RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516908.1

RNU6-352P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 352, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-352P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-352P-201ENST00000516908 STAG1Q8WVM7 1258 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TBC1D5Q92609 795 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 UBE2FQ969M7 185 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC12A9Q9BXP2 914 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SPATC1LQ9H0A9 340 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 AS3MTQ9HBK9 375 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TOMM22Q9NS69 142 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TMOD4Q9NZQ9 345 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 COL20A1Q9P218 1284 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 NYAP2Q9P242 653 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SWAP70Q9UH65 585 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SCN5AQ14524 2016 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SZT2Q5T011 3432 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 GBF1Q92538 1859 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 MYH7BA7E2Y1 1941 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 WDR81Q562E7 1941 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TMEM232C9JQI7 657 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 PLD2O14939 933 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 AURKAO14965 403 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 WDR46O15213 610 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 CYTH3O43739 400 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 PLEKHA8P1O95397 391 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 THBDP07204 575 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SYPP08247 313 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TSPY3P0CV98 308 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TSPY8P0CW00 308 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 PDHBP11177 359 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 FOSL1P15407 271 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 GNAT2P19087 354 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 ADORA2AP29274 412 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 BMP8BP34820 402 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 KCNJ6P48051 423 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 MASP1P48740 699 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 CLCN7P51798 805 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 POU4F1Q01851 419 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 MAP4K2Q12851 820 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 GRB14Q14449 540 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 PLS1Q14651 629 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 WDR78Q5VTH9 848 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 CREB3L3Q68CJ9 461 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 CPXCR1Q8N123 301 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 IL31RAQ8NI17 732 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC7A14Q8TBB6 771 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 NETO1Q8TDF5 533 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 FRS2Q8WU20 508 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 COPS5Q92905 334 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 FOXP3Q9BZS1 431 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 CABP5Q9NP86 173 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 GPRC5CQ9NQ84 441 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 STX8Q9UNK0 236 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 PFASO15067 1338 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TNKSO95271 1327 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 RAD50Q92878 1312 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 C2orf71A6NGG8 1288 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TSPY2A6NKD2 308 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 C19orf81C9J6K1 198 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 RFPL3O75679 317 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF205O95201 554 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TTLL1O95922 423 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TGFB1P01137 390 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 ESR1P03372 595 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 FURINP09958 794 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 SNHG28P0DPA3 235 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 CYBAP13498 195 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF543Q08ER8 600 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 NECTIN1Q15223 517 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 CCDC96Q2M329 555 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-352P-201ENST00000516908 TM4SF20Q53R12 229 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms