RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504334.5

SPATA20-208, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 2

Gene SPATA20, Length 3,539 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-208	ENST00000504334	MXI1	P50539	228 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	STAT2	P52630	851 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	SNX3	O60493	162 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CREB1	P16220	341 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CD101	Q93033	1021 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	UBOX5	O94941	541 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	ECE1	P42892	770 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	RASA3	Q14644	834 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	TCEAL1	Q15170	157 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	GZMA	P12544	262 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	KRT17	Q04695	432 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	P4HA2	O15460	535 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	MUT	P22033	750 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	TRAF1	Q13077	416 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	GDAP1	Q8TB36	358 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	C21orf2	O43822	256 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	MTA2	O94776	668 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	AFF2	P51816	1311 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	SUN1	O94901	812 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CYP1A2	P05177	515 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CHKA	P35790	457 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	VPS41	P49754	854 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	MFAP3	P55082	362 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	FMO1	Q01740	532 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	USP21	Q9UK80	565 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	KCNJ2	P63252	427 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	MTA1	Q13330	715 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	KYNU	Q16719	465 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	SERPINB12	Q96P63	405 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	LRRC19	Q9H756	370 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	ACCSL	Q4AC99	568 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPATA20-208	ENST00000504334	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21

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