RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM63Q969Q1 353 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 FERMT2Q96AC1 680 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 DCAF5Q96JK2 942 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM167AQ96KS9 214 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ACAP3Q96P50 834 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CDH19Q9H159 772 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 WNT5BQ9H1J7 359 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCB6Q9NP58 842 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SNTG2Q9NY99 539 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1B0GVC2 190 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 L7N2F9 121 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 MASP2O00187 686 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 HAT1O14929 419 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 B4GALT4O60513 344 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 PDHA1P08559 390 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 HSD3B1P14060 373 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CTNNA2P26232 953 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ANXA13P27216 316 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SERPINB3P29508 390 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 RPP38P78345 283 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GBE1Q04446 702 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CBX3Q13185 183 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 FUT11Q495W5 492 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CEP55Q53EZ4 464 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 LCE2CQ5TA81 110 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TPGS2Q68CL5 300 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRC31Q6UY01 552 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CABP7Q86V35 215 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 P3H2Q8IVL5 708 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 OR8K3Q8NH51 312 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CAGE1Q8TC20 777 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SHC3Q92529 594 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 KIFAP3Q92845 792 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GJA10Q969M2 543 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF653Q96CK0 615 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CEP19Q96LK0 163 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SMC6Q96SB8 1091 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ZPBPQ9BS86 351 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 FSD1Q9BTV5 496 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC106Q9BWC9 280 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CFL2Q9Y281 166 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ERICH2A1L162 156 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM247A6NEH6 219 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLGA8SH3BPF8 625 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 DGKIO75912 1065 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 MYZAPP0CAP1 466 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CSF2RAP15509 400 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 XPAP23025 273 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 IFNAR2P48551 515 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 DGKGP49619 791 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 VPS41P49754 854 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 VEGFBP49765 207 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 HAND2P61296 217 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TXNRD1Q16881 649 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 KANK2Q63ZY3 851 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NEPROQ6NW34 567 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms