RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491240.5

RBM3-211, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM3, Length 951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-211ENST00000491240 EFEMP2O95967 443 aa17.99■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 AVPR2P30518 371 aa17.99■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 GLRA4Q5JXX5 417 aa17.99■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 MCTP1Q6DN14 999 aa17.99■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 CEP57Q86XR8 500 aa17.99■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 PRIMPOLQ96LW4 560 aa17.99■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 CCDC113Q9H0I3 377 aa17.99■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 STK39Q9UEW8 545 aa17.99■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa17.99■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 KMT2EQ8IZD2 1858 aa17.99■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 ACKR2O00590 384 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 PTGESO14684 152 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 NAMPTP43490 491 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 TRAPPC10P48553 1259 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 TCF15Q12870 199 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 TUSC3Q13454 348 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 IL17AQ16552 155 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 FAM187BQ17R55 369 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 USP41Q3LFD5 358 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 RTP2Q5QGT7 225 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 NT5DC1Q5TFE4 455 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 IFT74Q96LB3 600 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 ADPGKQ9BRR6 497 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 KCNH6Q9H252 994 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 RXFP1Q9HBX9 757 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 CHST7Q9NS84 486 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 DENND4AQ7Z401 1863 aa17.98■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 CCDC169A6NNP5 214 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 TGM5O43548 720 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 KIF4AO95239 1232 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.472e-28■■□□□ 11.9
RBM3-211ENST00000491240 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 PPP2R5AQ15172 486 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 FAM171A1Q5VUB5 890 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 OTOP3Q7RTS5 596 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 UBALD2Q8IYN6 164 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 PLCD3Q8N3E9 789 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 RSAD2Q8WXG1 361 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 PLIN2Q99541 437 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 PIDD1Q9HB75 910 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 USTQ9Y2C2 406 aa17.97■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 THP07101 528 aa17.96■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 PEX3P56589 373 aa17.96■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 OSTNP61366 133 aa17.96■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 KCNK18Q7Z418 384 aa17.96■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 RUSC1Q9BVN2 902 aa17.96■□□□□ 0.47
RBM3-211ENST00000491240 SFI1A8K8P3 1242 aa17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 HIP1RO75146 1068 aa17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 PTPN5P54829 565 aa17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 ATF7IP2Q5U623 682 aa17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 CEP120Q8N960 986 aa17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 IGSF22Q8N9C0 903 aa17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 KIFAP3Q92845 792 aa17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 MFSD1Q9H3U5 465 aa17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa17.95■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.466e-16■■■■■ 53.5
RBM3-211ENST00000491240 DOCK6Q96HP0 2047 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 TRIP11Q15643 1979 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 H0Y858 1186 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 K7ERI5 159 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 ADAM12O43184 909 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 NARSO43776 548 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 HARSP12081 509 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 MUTP22033 750 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 RABEP1Q15276 862 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 PSMD5Q16401 504 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 KRT79Q5XKE5 535 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 TMEM105Q8N8V8 129 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 FLCNQ8NFG4 579 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 MYADMQ96S97 322 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 RAB34Q9BZG1 259 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 KCNK12Q9HB15 430 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 DNM3Q9UQ16 869 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 CLUHO75153 1309 aa17.94■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 I3L4J1 428 aa17.93■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 NPTX2P47972 431 aa17.93■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 TDGQ13569 410 aa17.93■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 PDIA5Q14554 519 aa17.93■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 NAB2Q15742 525 aa17.93■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa17.93■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa17.93■□□□□ 0.46
RBM3-211ENST00000491240 DTHD1Q6ZMT9 781 aa17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms