RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	PARP2	Q9UGN5	583 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	NR1I2	O75469	434 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FGF18	O76093	207 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF202	O95125	648 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	GCNT3	O95395	438 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ITGB1	P05556	798 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	AKAP5	P24588	427 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	KRT17	Q04695	432 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PSMD2	Q13200	908 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	XKR4	Q5GH76	650 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	STAM	Q92783	540 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ACAP3	Q96P50	834 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	APOL6	Q9BWW8	343 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SNTG2	Q9NY99	539 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	MYO7A	Q13402	2215 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0B4J269	797 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	RFXAP	O00287	272 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	OGT	O15294	1046 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ALDH2	P05091	517 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TH	P07101	528 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	GALT	P07902	379 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CLTA	P09496	248 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	IGFBP4	P22692	258 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	AFM	P43652	599 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	BCAR1	P56945	870 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP42	Q96MM3	310 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TIGD1	Q96MW7	591 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	USP20	Q9Y2K6	914 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FSD2	A1L4K1	749 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	POMC	P01189	267 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SCNN1G	P51170	649 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TUSC3	Q13454	348 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CUL4B	Q13620	913 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM169	Q96HH4	297 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SNX27	Q96L92	541 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CNTN3	Q9P232	1028 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	HCST	Q9UBK5	93 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	GDA	Q9Y2T3	454 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PTGES	O14684	152 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	GRM6	O15303	877 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	NCK2	O43639	380 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	KLRC4	O43908	158 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FAM189A1	O60320	539 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ADRB2	P07550	413 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	MYB	P10242	640 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	KCNE1	P15382	129 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	GART	P22102	1010 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CASP5	P51878	434 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB33	Q86T24	672 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CD302	Q8IX05	232 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	IGSF21	Q96ID5	467 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	UROC1	Q96N76	676 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TLR9	Q9NR96	1032 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PTPA-222	ENST00000445241	EXOC1	Q9NV70	894 aa		15.97	■□□□□ 0.15

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