RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439008.1

LINC00399-201, long intergenic non-protein coding RNA 399, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00399, Length 414 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00399-201ENST00000439008 GLP2RO95838 553 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 CASP5P51878 434 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 SMTNP53814 917 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 OSTNP61366 133 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 GTF2BQ00403 316 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 HLA-CQ95604 372 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 IGFLR1Q9H665 355 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 CFAP45Q9UL16 551 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 TBX20Q9UMR3 447 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 TBX10O75333 385 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 BMP1P13497 986 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 PPM1AP35813 382 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 GRM5P41594 1212 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 NRIP1P48552 1158 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 VPS52Q8N1B4 723 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 HPS3Q969F9 1004 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ASB2Q96Q27 587 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 TCF25Q9BQ70 676 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ZBP1Q9H171 429 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ANK1P16157 1881 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 TOM1L1O75674 476 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 PIGRP01833 764 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ALDH2P05091 517 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 MYBP10242 640 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 MCF2P10911 925 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 KCNA5P22460 613 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 OR1G1P47890 313 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 MCL1Q07820 350 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 GRIK3Q13003 919 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 STRN3Q13033 797 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ADAM15Q13444 863 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 KCNC3Q14003 757 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 XKR4Q5GH76 650 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ZPBP2Q6X784 338 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 TMEM169Q96HH4 297 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 SPATA32Q96LK8 384 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 TRIM9Q9C026 710 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 CLDND1Q9NY35 253 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 CLEC1BQ9P126 229 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 VWA8A3KMH1 1905 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 A0A1B0GVL5 298 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 LILRB3O75022 631 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 IDEP14735 1019 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 TNFSF9P41273 254 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 KRT85P78386 507 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 KRT17Q04695 432 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 DUSP6Q16828 381 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 TMC7Q7Z402 723 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 HACE1Q8IYU2 909 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00399-201ENST00000439008 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms