RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 FKBP1BP68106 108 aa25.03■■□□□ 1.6
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FAAP20-209ENST00000428120 SHC3Q92529 594 aa25.03■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 KCNN1Q92952 543 aa25.03■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 NLRP4Q96MN2 994 aa25.03■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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FAAP20-209ENST00000428120 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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FAAP20-209ENST00000428120 GPR142Q7Z601 462 aa25.03■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC57Q8N9N7 239 aa25.03■■□□□ 1.6
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FAAP20-209ENST00000428120 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.03■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 INTUQ9ULD6 942 aa25.03■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 MSCO60682 206 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 BIRC3Q13489 604 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 DPP9Q86TI2 863 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 TCP11Q8WWU5 503 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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FAAP20-209ENST00000428120 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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FAAP20-209ENST00000428120 EVPLQ92817 2033 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC151A5D8V7 595 aa25.02■■□□□ 1.6
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FAAP20-209ENST00000428120 SCP2P22307 547 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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FAAP20-209ENST00000428120 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 ILDR2Q71H61 639 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 SLC35G2Q8TBE7 412 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 VTI1AQ96AJ9 217 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 ARFGAP3Q9NP61 516 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-209ENST00000428120 CALCAP01258 141 aa25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF286BP0CG31 522 aa25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 TNFSF9P41273 254 aa25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA4Q8NEY3 305 aa25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 AFG1LQ8WV93 481 aa25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 HINFPQ9BQA5 517 aa25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 PPME1Q9Y570 386 aa25.01■■□□□ 1.59
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC26A2P50443 739 aa25.01■■□□□ 1.59
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FAAP20-209ENST00000428120 EFCAB12Q6NXP0 572 aa25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHB18PQ96TA0 734 aa25.01■■□□□ 1.59
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FAAP20-209ENST00000428120 STRNO43815 780 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 HBP1O60381 514 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 ZMYND10O75800 440 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 HLA-DRAP01903 254 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 PRKCBP05771 671 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM253P0C7T8 217 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 LAMC2Q13753 1193 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 BRD3Q15059 726 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 DAAM2Q86T65 1068 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 VTA1Q9NP79 307 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 ATP8B3O60423 1300 aa25■■□□□ 1.59
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FAAP20-209ENST00000428120 PIK3CAP42336 1068 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 MAPK6Q16659 721 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25■■□□□ 1.59
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FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R16BQ96T49 567 aa25■■□□□ 1.59
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FAAP20-209ENST00000428120 KATNBL1Q9H079 304 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf112Q9NSG2 853 aa25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 MMEP08473 750 aa24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 PAFAH1B1P43034 410 aa24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 RPS6KA1Q15418 735 aa24.99■■□□□ 1.59
FAAP20-209ENST00000428120 CST9Q5W186 159 aa24.99■■□□□ 1.59
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