RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPTLC1	O15269	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MCM7	P33993	719 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTEN	P60484	403 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UNC13D	Q70J99	1090 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PGM3	O95394	542 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CSF1R	P07333	972 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FCER1A	P12319	257 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNIP1	Q15025	636 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BCL2A1	Q16548	175 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMIM5	Q71RC9	77 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DISC1	Q9NRI5	854 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PFAS	O15067	1338 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC22	O60826	627 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOL4	O94818	638 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	XBP1	P17861	261 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CRABP2	P29373	138 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RFC4	P35249	363 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RXRG	P48443	463 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RELA	Q04206	551 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDC16	Q13042	620 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF22	Q14807	665 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAN2A1	Q16706	1144 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q6ZNX1	250 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACAD11	Q709F0	780 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	JAML	Q86YT9	394 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYH4	Q9Y623	1939 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC160	A6NGH7	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658		E9PBE3	544 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RARG	P13631	454 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AMPD1	P23109	780 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BAG6	P46379	1132 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERF	P50548	548 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDE4D	Q08499	809 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C14orf80	Q86SX3	495 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BBS5	Q8N3I7	341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GYG2	O15488	501 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANPEP	P15144	967 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PCSK6	P29122	969 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STRN3	Q13033	797 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRM2	Q14416	872 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SERPINB12	Q96P63	405 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63

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