RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMD6Q15008 389 aa18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 SURF1Q15526 300 aa18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 MIIPQ5JXC2 388 aa18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCERG1LQ5VWI1 586 aa18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRSK2Q8IWQ3 736 aa18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 PARD3BQ8TEW8 1205 aa18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 OSBPL7Q9BZF2 842 aa18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA0355O15063 1070 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL18RAPO95256 599 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADCY5O95622 1261 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 AFPP02771 609 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 RFC2P35250 354 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFSF9P41273 254 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB27AP51159 221 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF75DP51815 510 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 DSC3Q14574 896 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBXN11Q5T124 520 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 FKBP15Q5T1M5 1219 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 APBB2Q92870 758 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACAP3Q96P50 834 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 FNBP1Q96RU3 617 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 UMODL1Q5DID0 1318 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 PES1O00541 588 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBNO60934 754 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXCL10P02778 98 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 SKIP12755 728 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLDN10P78369 228 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNH2Q12809 1159 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEZ6Q53EL9 994 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD302Q8IX05 232 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 HACE1Q8IYU2 909 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP120Q8N960 986 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEPT8Q92599 483 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABHD8Q96I13 439 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 WNT8AQ9H1J5 351 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMX1Q9H3N1 280 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 KAT6AQ92794 2004 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRCA2P51587 3418 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIMP1P01033 207 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 GTF2H1P32780 548 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYP2C18P33260 490 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 YARSP54577 528 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCL23P55773 120 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 OSTNP61366 133 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBXN1Q04323 297 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPNMBQ14956 572 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAM2Q99965 735 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASB7Q9H672 318 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 IPPQ9Y573 584 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 EVPLQ92817 2033 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0U1RQF3 1178 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF623O75123 536 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC25BP30305 580 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 AP3M2P53677 418 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 DLG4P78352 724 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHO2Q8TD55 490 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPAN18Q96SJ8 248 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGS18Q9NS28 235 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 INTS13Q9NVM9 706 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PQC6 194 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC26A0AVF1 554 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 PMM2O15305 246 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 P4HA2O15460 535 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 MGEA5O60502 916 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM49P0CI25 452 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM49CP0CI26 452 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXCL8P10145 99 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 DLATP10515 647 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAG1P15918 1043 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 FMO5P49326 533 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf220Q5T0J3 134 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR49Q8IV35 697 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM192Q8IY95 271 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms