RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 GPR149Q86SP6 731 aa24.8■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.8■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 DNM3Q9UQ16 869 aa24.8■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 STK24Q9Y6E0 443 aa24.8■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 DOCK6Q96HP0 2047 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 PEX3P56589 373 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 SIGLEC14Q08ET2 396 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 PBXIP1Q96AQ6 731 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 ASIC4Q96FT7 647 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 PNMA5Q96PV4 448 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 SMOC2Q9H3U7 446 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 MAN1C1Q9NR34 630 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 GDAQ9Y2T3 454 aa24.79■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 CITO14578 2027 aa24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 HIP1RO75146 1068 aa24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 NPTX2P47972 431 aa24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 MAPK7Q13164 816 aa24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 TUSC3Q13454 348 aa24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 HASPINQ8TF76 798 aa24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 CCDC169A6NNP5 214 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 H3BQV1 296 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 K7ERI5 159 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 TADA2AO75478 443 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 ASGR2P07307 311 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 ADH1AP07327 375 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 SPATA31D3P0C874 917 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 RPL17P18621 184 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 EFNA5P52803 228 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 USP41Q3LFD5 358 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 KREMEN2Q8NCW0 462 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 PLIN2Q99541 437 aa24.77■■□□□ 1.56
KDELR3-202ENST00000409006 SFI1A8K8P3 1242 aa24.76■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 KIF4AO95239 1232 aa24.76■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 THP07101 528 aa24.76■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 ZBTB33Q86T24 672 aa24.76■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 PALB2Q86YC2 1186 aa24.76■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 LIMD1Q9UGP4 676 aa24.76■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.76■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 DOCK8Q8NF50 2099 aa24.76■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 RFPL2O75678 378 aa24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 BRD1O95696 1058 aa24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 GLUD1P00367 558 aa24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 RTP2Q5QGT7 225 aa24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 HYIQ5T013 277 aa24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 CEP120Q8N960 986 aa24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 WDFY4Q6ZS81 3184 aa24.75■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 MCM2P49736 904 aa24.74■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa24.74■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.74■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.74■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.74■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.74■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 SORCS3Q9UPU3 1222 aa24.74■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 USTQ9Y2C2 406 aa24.74■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.74■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 TGM5O43548 720 aa24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 IER5LQ5T953 404 aa24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 LILRA6Q6PI73 481 aa24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 CDT1Q9H211 546 aa24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 FNIP2Q9P278 1114 aa24.73■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 CCDC149Q6ZUS6 474 aa24.72■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 GPR65Q8IYL9 337 aa24.72■■□□□ 1.55
KDELR3-202ENST00000409006 FBXL6Q8N531 539 aa24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms