RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 OGTO15294 1046 aa21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 TPM1P09493 284 aa21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 FIGNQ5HY92 759 aa21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 TMC2Q8TDI7 906 aa21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 PANX2Q96RD6 677 aa21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CCL5P13501 91 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 PSMD6Q15008 389 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 LMO3Q8TAP4 145 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 BAP1Q92560 729 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 RNF208Q9H0X6 261 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 A0A1B0GUA9 196 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CDC42EP1Q00587 391 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 NME8Q8N427 588 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 DNAJC7Q99615 494 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.86■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 A0A1W2PQJ5 194 aa21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CABYRO75952 493 aa21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CHRNA1P02708 482 aa21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 MXI1P50539 228 aa21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 MTF1Q14872 753 aa21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 WDR59Q6PJI9 974 aa21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 SEMA4DQ92854 862 aa21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 FAM212AQ96EL1 285 aa21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 LRRC53A6NM62 1247 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 ZBED6P86452 979 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 EPC2Q52LR7 807 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 SV2AQ7L0J3 742 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 RRAGAQ7L523 313 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 OR8K1Q8NGG5 319 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CXCL8P10145 99 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 UCHL3P15374 230 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 TNNI1P19237 187 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 THPOP40225 353 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CLDN10P78369 228 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 FNBP1Q96RU3 617 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CHP1Q99653 195 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CEP72Q9P209 647 aa21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.83■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.83■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 PHF24Q9UPV7 400 aa21.83■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 TRIP11Q15643 1979 aa21.83■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 KBTBD13C9JR72 458 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 B4GALT4O60513 344 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 STAG3L1P0CL83 205 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 MCF2P10911 925 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 LBX1P52954 281 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 KRT39Q6A163 491 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 FAM228AQ86W67 206 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 CCDC51Q96ER9 411 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 HES2Q9Y543 173 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 NPTXRO95502 500 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 IQCEQ6IPM2 695 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 NOD1Q9Y239 953 aa21.82■■□□□ 1.08
ODC1-202ENST00000405333 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms