RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 TGFB1I1O43294 461 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 LDHAP00338 332 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 HARSP12081 509 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 AKAP5P24588 427 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ADSSP30520 456 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 MLH1P40692 756 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 PPP1R2P41236 205 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 YARSP54577 528 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ARMCX5Q6P1M9 558 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 THNSL1Q8IYQ7 743 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM174Q8WUU8 243 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ACAP3Q96P50 834 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 MSTO1Q9BUK6 570 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 KIAA1468Q9P260 1216 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 GDAQ9Y2T3 454 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 CARNS1A5YM72 827 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ARL5CA6NH57 179 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 CLTAP09496 248 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 LINC00271P0C7V0 271 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 TAP1Q03518 808 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 GRIK3Q13003 919 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 CAMK4Q16566 473 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 GSTCDQ8NEC7 633 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 LRCH3Q96II8 777 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 GAD1Q99259 594 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 PDXKO00764 312 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ARHGEF15O94989 841 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 LAG3P18627 525 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ERVK-21P61565 698 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 MORC3Q14149 939 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 XKR4Q5GH76 650 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM192Q8IY95 271 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 SNX27Q96L92 541 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ZFP42Q96MM3 310 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 CWH43Q9H720 699 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 CNTN3Q9P232 1028 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 C5orf67F2Z3F1 127 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 PTGESO14684 152 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ADRB2P07550 413 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 TNFSF9P41273 254 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 SCNN1GP51170 649 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 OSTNP61366 133 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 NFIL3Q16649 462 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF697Q5TEC3 545 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 CD302Q8IX05 232 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 GPD1LQ8N335 351 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 PLVAPQ9BX97 442 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF576Q9H609 170 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 AAASQ9NRG9 546 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 KLK14Q9P0G3 267 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 TTC26A0AVF1 554 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 EXTL3O43909 919 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 POMCP01189 267 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 THP07101 528 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 CXCL8P10145 99 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 PRCPP42785 496 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 DSC1Q08554 894 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 STIM1Q13586 685 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 MYBPC2Q14324 1141 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 SEZ6Q53EL9 994 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTBP8-201ENST00000403258 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms