RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 WNT8BQ93098 351 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC51Q96ER9 411 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PANX2Q96RD6 677 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CENPFP49454 3210 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1W2PQJ5 194 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 MCF2P10911 925 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 ACTN1P12814 892 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 TNNI1P19237 187 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PON1P27169 355 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.152e-7■■□□□ 14.5
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ATG4B-204ENST00000402096 FAM212AQ96EL1 285 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PHF24Q9UPV7 400 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 ANK1P16157 1881 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 HTTP42858 3142 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 FAM189A1O60320 539 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 THPOP40225 353 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 ZBED6P86452 979 aa22.23■■□□□ 1.15
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ATG4B-204ENST00000402096 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CEP72Q9P209 647 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1B0GUA9 196 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 DNM1LO00429 736 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 P4HA2O15460 535 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 ENPEPQ07075 957 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 KRT39Q6A163 491 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CEP120Q8N960 986 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 NOL4O94818 638 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 GTF2H1P32780 548 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 WNT7BP56706 349 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PTK7Q13308 1070 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CGRRF1Q99675 332 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CITO14578 2027 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 NPTXRO95502 500 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 LBX1P52954 281 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 NOTUMQ6P988 496 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 RRAGAQ7L523 313 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 GANQ9H2C0 597 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
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ATG4B-204ENST00000402096 AXLP30530 894 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM192Q8IY95 271 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 FAM84AQ96KN4 292 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJC7Q99615 494 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TMX1Q9H3N1 280 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SIX2Q9NPC8 291 aa22.2■■□□□ 1.14
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ATG4B-204ENST00000402096 CLTAP09496 248 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 CXCL8P10145 99 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 BIRC3Q13489 604 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SURF1Q15526 300 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 KYAT1Q16773 422 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 EPC2Q52LR7 807 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SV2AQ7L0J3 742 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 RPAINQ86UA6 219 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF516Q92618 1163 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC53A6NM62 1247 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 RPS6KA5O75582 802 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 UCHL3P15374 230 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-204ENST00000402096 FAM228AQ86W67 206 aa22.18■■□□□ 1.14
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