RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 VPS11Q9H270 941 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 POTECB2RU33 542 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA8RI6L899 631 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 STXBP3O00186 592 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 MYO1DO94832 1006 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 CAMTA2O94983 1202 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 GFAPP14136 432 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 PSMA2P25787 234 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 PEX3P56589 373 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 SKOR1P84550 965 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 KDSRQ06136 332 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ERICH1Q86X53 443 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 EPAS1Q99814 870 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 NUP85Q9BW27 656 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 APOL6Q9BWW8 343 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 COG4Q9H9E3 785 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 SENP2Q9HC62 589 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC78A2IDD5 438 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF197O14709 1029 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 SNX2O60749 519 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ESRRBO95718 433 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 GYPCP04921 128 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 KIF19Q2TAC6 998 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 RRM2BQ7LG56 351 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 MXD3Q9BW11 206 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 POLE3Q9NRF9 147 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 FAM107AO95990 144 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 HLA-DPA1P20036 260 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINB10P48595 397 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 STAT2P52630 851 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB33Q86T24 672 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ULK4Q96C45 1275 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ERP27Q96DN0 273 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 OLFM3Q96PB7 478 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 AKT3Q9Y243 479 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 LZTS1Q9Y250 596 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 SUPT3HO75486 399 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ANP32DO95626 131 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 SLC4A1P02730 911 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM49P0CI25 452 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM49CP0CI26 452 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF18P17022 549 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ADRA2BP18089 450 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 LONRF1Q17RB8 773 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 RAD54LQ92698 747 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 SGSM3Q96HU1 749 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L15C9J2P7 530 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L11C9JVI0 530 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L18D6R9N7 530 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L22D6RA61 530 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L19D6RCP7 530 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L20D6RJB6 530 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 AP5Z1O43299 807 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L24Q0WX57 530 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 DPYDQ12882 1025 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 CYTH1Q15438 398 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 MDM1Q8TC05 714 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 GANCQ8TET4 914 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 DCAF4Q8WV16 495 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 RFFLQ8WZ73 363 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 EXT2Q93063 718 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 PHF21AQ96BD5 680 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 C9orf72Q96LT7 481 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM260Q9NX78 707 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 EHD2Q9NZN4 543 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 RAD51CO43502 376 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 AGTP01019 485 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 MAPRE2Q15555 327 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 PTGISQ16647 500 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ADA2Q9NZK5 511 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF263O14978 683 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms