RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 USP54Q70EL1 1684 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 INSRP06213 1382 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 LCHNA4D1U4 455 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 GLTPD2A6NH11 291 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CYP27B1O15528 508 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 COL6A1P12109 1028 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 OSMP13725 252 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MAN1A1P33908 653 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ECE1P42892 770 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FNTBP49356 437 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CACNB3P54284 484 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CT83Q5H943 113 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 RNF32Q9H0A6 362 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 IPPQ9Y573 584 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 H0YIN7 160 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 GOLIM4O00461 696 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 KRIT1O00522 736 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 B3GALT2O43825 422 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 PSPNO60542 156 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 RPS6KA4O75676 772 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 UBXN7O94888 489 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FBLN1P23142 703 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CHRNA5P30532 468 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CCT5P48643 541 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 RTP1P59025 263 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MOGSQ13724 837 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 RNF220Q5VTB9 566 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CPZQ66K79 652 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 KCNK18Q7Z418 384 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 SKAP1Q86WV1 359 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 PRR18Q8N4B5 295 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TTLL6Q8N841 843 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 DEPTORQ8TB45 409 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 COA7Q96BR5 231 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 C16orf92Q96LL3 132 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TBCBQ99426 244 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 EDARQ9UNE0 448 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 X6R8D5 127 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 MAFKO60675 156 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 GYS1P13807 737 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 BDNFP23560 247 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 FPR2P25090 351 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SDHAP31040 664 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 GJA4P35212 333 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 TXKP42681 527 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 ITPK1Q13572 414 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SNX17Q15036 470 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 MLANAQ16655 118 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PGS1Q32NB8 556 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 DPP9Q86TI2 863 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 KRT78Q8N1N4 520 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SPATA5Q8NB90 893 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 MAML3Q96JK9 1138 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 ANO3Q9BYT9 981 aa6.58□□□□□ -1.36
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