RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.04■■□□□ 1.12
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RAB11B-201ENST00000328024 ARL5CA6NH57 179 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB11B-201ENST00000328024 RECQL4O94761 1208 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB11B-201ENST00000328024 GRM5P41594 1212 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB11B-201ENST00000328024 PSMD2Q13200 908 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB11B-201ENST00000328024 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
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RAB11B-201ENST00000328024 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB11B-201ENST00000328024 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.03■■□□□ 1.12
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RAB11B-201ENST00000328024 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.03■■□□□ 1.12
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RAB11B-201ENST00000328024 B4GALT3O60512 393 aa22.02■■□□□ 1.12
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RAB11B-201ENST00000328024 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.02■■□□□ 1.12
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RAB11B-201ENST00000328024 TNFSF9P41273 254 aa22.02■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.11
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RAB11B-201ENST00000328024 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.02■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 GPR153Q6NV75 609 aa22.02■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.02■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.02■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM206Q9H813 350 aa22.02■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.02■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.02■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 POMCP01189 267 aa22.01■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 SCNN1GP51170 649 aa22.01■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 GRIN2CQ14957 1233 aa22.01■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.01■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.01■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 SYCE3A1L190 88 aa22■■□□□ 1.11
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RAB11B-201ENST00000328024 DDHD2O94830 711 aa22■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 HACE1Q8IYU2 909 aa22■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 GSDMAQ96QA5 445 aa22■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 CBWD1Q9BRT8 395 aa22■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 MSTO1Q9BUK6 570 aa22■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 RFXAPO00287 272 aa21.99■■□□□ 1.11
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RAB11B-201ENST00000328024 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 LRRC43Q8N309 656 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.99■■□□□ 1.11
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RAB11B-201ENST00000328024 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 OGTO15294 1046 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 EPC2Q52LR7 807 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 HS1BP3Q53T59 392 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 ISM2Q6H9L7 571 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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RAB11B-201ENST00000328024 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 ACAP3Q96P50 834 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 GBP3Q9H0R5 595 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.99■■□□□ 1.11
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RAB11B-201ENST00000328024 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 UBE4BO95155 1302 aa21.99■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 SMC2O95347 1197 aa21.98■■□□□ 1.11
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RAB11B-201ENST00000328024 ACOT2P49753 483 aa21.98■■□□□ 1.11
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RAB11B-201ENST00000328024 XKR4Q5GH76 650 aa21.98■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.98■■□□□ 1.11
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RAB11B-201ENST00000328024 CXCL8P10145 99 aa21.97■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 BMP6P22004 513 aa21.97■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 NAB2Q15742 525 aa21.97■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.97■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 DEFB123Q8N688 67 aa21.97■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 URGCPQ8TCY9 931 aa21.97■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 SNX27Q96L92 541 aa21.97■■□□□ 1.11
RAB11B-201ENST00000328024 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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