RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 USP37Q86T82 979 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 PARD3BQ8TEW8 1205 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 NPTXRO95502 500 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TRIM49P0CI25 452 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TRIM49CP0CI26 452 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CDC25BP30305 580 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 DLG4P78352 724 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 KYAT1Q16773 422 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 PTPN21Q16825 1174 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 DRC7Q8IY82 874 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TMC2Q8TDI7 906 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CCDC51Q96ER9 411 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CHST12Q9NRB3 414 aa24.06■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 STAG3L1P0CL83 205 aa24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 ENPEPQ07075 957 aa24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 PSMD6Q15008 389 aa24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CLTAP09496 248 aa24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 MBTPS1Q14703 1052 aa24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 FNBP1Q96RU3 617 aa24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 HIPK3Q9H422 1215 aa24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 SCN5AQ14524 2016 aa24.05■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.04■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 UBXN11Q5T124 520 aa24.04■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 VSTM4Q8IW00 320 aa24.04■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TMEM192Q8IY95 271 aa24.04■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.04■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.04■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.04■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 PBX1P40424 430 aa24.03■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 GRM5P41594 1212 aa24.03■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 C1orf220Q5T0J3 134 aa24.03■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 SPC24Q8NBT2 197 aa24.03■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 FAM212AQ96EL1 285 aa24.03■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TET1Q8NFU7 2136 aa24.03■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 A0A1W2PQC6 194 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 FMO5P49326 533 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 WNT7BP56706 349 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 PPP3CAQ08209 521 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TMC6Q7Z403 805 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 ACAP3Q96P50 834 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 ERGIC2Q96RQ1 377 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 STX10O60499 249 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CLTBP09497 229 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CXCL8P10145 99 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 SURF1Q15526 300 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TMX1Q9H3N1 280 aa24.02■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TNNI1P19237 187 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 GCLMP48507 274 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 CLDN10P78369 228 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 SYCP1Q15431 976 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 CBWD6Q4V339 395 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 SNTG2Q9NY99 539 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 TBX21Q9UL17 535 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 HES2Q9Y543 173 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 GTF2H1P32780 548 aa24■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 NBNO60934 754 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 IL18RAPO95256 599 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 DSC3Q14574 896 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 CGRRF1Q99675 332 aa23.99■■□□□ 1.43
CTU2-201ENST00000312060 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
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