RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 MCF2P10911 925 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SKIP12755 728 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GRM5P41594 1212 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PRCPP42785 496 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ACOT2P49753 483 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SCNN1GP51170 649 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 WNT7BP56706 349 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SPAG1Q07617 926 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PSMD2Q13200 908 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ALCAMQ13740 583 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 Q7L0L9 218 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 POMGNT1Q8WZA1 660 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TIFAQ96CG3 184 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SAAL1Q96ER3 474 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 MSTO1Q9BUK6 570 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 KCTD10Q9H3F6 313 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 MSRAQ9UJ68 235 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 EPOPA6NHQ4 379 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 RFXAPO00287 272 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SMC2O95347 1197 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CXCL8P10145 99 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SCP2P22307 547 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 RAB30Q15771 203 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GLB1LQ6UWU2 654 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ABI1Q8IZP0 508 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 RABGGTAQ92696 567 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PGBD4Q96DM1 585 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 FAM84AQ96KN4 292 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GBP3Q9H0R5 595 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CWH43Q9H720 699 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 F8W810 466 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 OGTO15294 1046 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 MORC3Q14149 939 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 FIBCD1Q8N539 461 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF576Q9H609 170 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM206Q9H813 350 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 MYO7AQ13402 2215 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ABCD1P33897 745 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CYP2J2P51589 502 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 NAB2Q15742 525 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SNX27Q96L92 541 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ACAP3Q96P50 834 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PAAF1Q9BRP4 392 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CITO14578 2027 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 UBE4BO95155 1302 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TTC26A0AVF1 554 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 LACTBL1A8MY62 500 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 INPPL1O15357 1258 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 HOXA2O43364 376 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CLTAP09496 248 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GRIN2CQ14957 1233 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms