RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.02□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.02□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 A0A1W2PRQ8 180 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SGSM2O43147 1006 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 TMCC2O75069 709 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 TMEM127O75204 238 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 KRT9P35527 623 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 RAD52P43351 418 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 FLT3LGP49771 235 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 CREMQ03060 361 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 ADAM9Q13443 819 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 FAM71BQ8TC56 605 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 STYXQ8WUJ0 223 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SEC14L1Q92503 715 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 RILPL2Q969X0 211 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SUCLG2Q96I99 432 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 CNPPD1Q9BV87 410 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 DPH1Q9BZG8 443 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 PALD1Q9ULE6 856 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.01□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 ARIH2O95376 493 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 GLI4P10075 376 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 VDRP11473 427 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 TERF1P54274 439 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 NR1H2P55055 460 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 TLE1Q04724 770 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SNAPC2Q13487 334 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 AOC3Q16853 763 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 GPR156Q8NFN8 814 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 IFI44Q8TCB0 444 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SPPL3Q8TCT6 385 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 FAM167BQ9BTA0 163 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 TM7SF3Q9NS93 570 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 TDP1Q9NUW8 608 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 FTSJ1Q9UET6 329 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 PCDHA6Q9UN73 950 aa7□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 A0A0B4J269 797 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 CLCA1A8K7I4 914 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SYN1P17600 705 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 MALP21145 153 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 RPS6KB1P23443 525 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 DCAF7P61962 342 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 TIGD6Q17RP2 521 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 IQCDQ96DY2 449 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SOX7Q9BT81 388 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.98□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 SOAT2O75908 522 aa6.98□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 TNFRSF6BO95407 300 aa6.98□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 ITGA5P08648 1049 aa6.98□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 PTGS1P23219 599 aa6.98□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 AFMP43652 599 aa6.98□□□□□ -1.29
MDM2-201ENST00000258148 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms