RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.73■■□□□ 1.39
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HTATSF1-201ENST00000218364 CYP26A1O43174 497 aa23.72■■□□□ 1.39
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HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 ACP6Q9NPH0 428 aa23.7■■□□□ 1.38
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HTATSF1-201ENST00000218364 PTK6Q13882 451 aa23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 ACAD10Q6JQN1 1059 aa23.68■■□□□ 1.38
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HTATSF1-201ENST00000218364 CHKAP35790 457 aa23.68■■□□□ 1.38
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HTATSF1-201ENST00000218364 GRIN3BO60391 1043 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 SUN1O94901 812 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 ACSL3O95573 720 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 MAN1A1P33908 653 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC14Q15048 493 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1-201ENST00000218364 TCP11Q8WWU5 503 aa23.67■■□□□ 1.38
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