RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prss23Q9D6X6 382 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf225Q9D7D1 332 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PdiltQ9DAN1 588 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifi202Q9R002 445 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lypla2Q9WTL7 231 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mpp2Q9WV34 552 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Noc2lQ9WV70 747 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ggt5Q9Z2A9 573 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr161B2RPY5 545 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rfx8D3YU81 596 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Magea4F2Z493 315 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4933406M09RikG3XA12 479 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rad51bO35719 350 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajb6O54946 365 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc3a2P10852 526 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp11b2P15539 500 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt19P19001 403 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cxcr2P35343 359 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LxnP70202 222 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pih1d3Q3KNI6 218 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 R3hdm4Q4VBF2 262 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nell2Q61220 819 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt77Q6IFZ6 572 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem117Q8BH18 514 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rsad2Q8CBB9 362 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spire2Q8K1S6 718 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cplx3Q8R1B5 158 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gmcl1Q920G9 524 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Med24Q99K74 987 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sdr42e1Q9D665 394 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpina9Q9D7D2 418 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Extl2Q9ES89 330 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp275G3X904 499 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3182K7N6T8 263 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mnat1P51949 309 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Palb2Q3U0P1 1104 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc125Q5U465 500 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb17Q60821 794 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpa1Q7TPZ8 419 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q80WR5 230 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pkn2Q8BWW9 983 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp120Q8BZW4 436 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh3rf3Q8C120 878 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc12a8Q8VI23 705 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Havcr2Q8VIM0 281 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspbp1Q99P31 357 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nsmce1Q9D720 266 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PycardQ9EPB4 193 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uts2Q9QZQ3 123 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mta2Q9R190 668 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scn3aA2ASI5 1947 aa7.06□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ltbp1Q8CG19 1712 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taf1Q80UV9 1891 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oip5A2AQ14 241 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp35M0QWN7 1009 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GalcP54818 684 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ncf1Q09014 390 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Yipf3Q3UDR8 347 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Msantd2Q6NZR2 559 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc7a6osQ7TPE5 306 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PhkbQ7TSH2 1085 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BGN9 141 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btnl9Q8BJE2 536 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kctd6Q8BNL5 237 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc9a9Q8BZ00 644 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Epc2Q8C0I4 808 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp449Q8CB76 518 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IdeQ9JHR7 1019 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ecel1Q9JMI0 775 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr552E9Q545 317 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp212G3X8R7 492 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MyocO70624 490 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fgfr1P16092 822 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adcy7P51829 1099 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uhmk1P97343 419 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igsf9Q05BQ1 1179 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Large2Q5XPT3 690 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SkiQ60698 725 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sema5aQ62217 1077 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp1r13bQ62415 1087 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klra3Q64329 266 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q6DFW0 481 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhdc10Q6PAR0 439 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam20aQ8CID3 541 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd6Q8K2J9 488 aa7.05□□□□□ -1.28
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MyripQ8K3I4 856 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.2 ms