RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612928.1

5S_rRNA.16-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KLC1Q07866 573 aa4.82□□□□□ -1.64
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5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PSMC6P62333 389 aa4.81□□□□□ -1.64
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5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ENPEPQ07075 957 aa4.81□□□□□ -1.64
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