RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PADI3	Q9ULW8	664 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACOT2	P49753	483 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRE11	P49959	708 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOTUM	Q6P988	496 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDT1	Q9H211	546 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBX21	Q9UL17	535 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNA14	O95837	355 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT31	Q15323	416 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP120	Q8N960	986 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXL18	Q96ME1	805 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPR182	O15218	404 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM189A1	O60320	539 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SERPINC1	P01008	464 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLTB	P09497	229 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FANCC	Q00597	558 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPAG1	Q07617	926 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAK2	Q13177	524 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPD1L	Q8N335	351 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	BORCS6	Q96GS4	357 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	EXTL3	O43909	919 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADRB2	P07550	413 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	AXL	P30530	894 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP2C18	P33260	490 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCL23	P55773	120 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	OSTN	P61366	133 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP38	Q8NB14	1042 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	N4BP3	O15049	544 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	OGT	O15294	1046 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBN	O60934	754 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNFSF9	P41273	254 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPNMB	Q14956	572 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABHD8	Q96I13	439 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCLY	Q96I15	445 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	VPS16	Q9H269	839 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFNK	Q9P0W0	207 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF233	A6NK53	670 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCF2	P10911	925 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM192	Q8IY95	271 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMX1	Q9H3N1	280 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TET1	Q8NFU7	2136 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPTXR	O95502	500 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBASH3A	P57075	661 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SARM1	Q6SZW1	724 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM5	Q9C035	493 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	HES2	Q9Y543	173 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP290	O15078	2479 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBXN11	Q5T124	520 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		9.97	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms