RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587539.1

ZNF404-202, Transcript of zinc finger protein 404, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene ZNF404, Length 1,851 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404-202ENST00000587539 GOLGA8AA7E2F4 631 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 LEFTY2O00292 366 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 NRP1O14786 923 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 TMEM127O75204 238 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 ITGA10O75578 1167 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 NR4A1P22736 598 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 GZMKP49863 264 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 FAM189BP81408 668 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 IQSEC1Q6DN90 963 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 SDE2Q6IQ49 451 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 STON2Q8WXE9 905 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 MLST8Q9BVC4 326 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 TEX101Q9BY14 249 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 ENKD1Q9H0I2 346 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 POGKQ9P215 609 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 CDY2AQ9Y6F7 541 aa3.5□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 MTSS1O43312 755 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 AKR1B10O60218 316 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 CTSSP25774 331 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 CNGA1P29973 690 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 MASP1P48740 699 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 GPR15P49685 360 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 DHCR24Q15392 516 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 FAM83AQ86UY5 434 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 HAS1Q92839 578 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 CEP95Q96GE4 821 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 WNT10BO00744 389 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 LPXNO60711 386 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 PTPN7P35236 360 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 SLC35B2Q8TB61 432 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 COG1Q8WTW3 980 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 CHAC2Q8WUX2 184 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 SNX33Q8WV41 574 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 SLC2A13Q96QE2 648 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 AGAP2Q99490 1192 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 CAAP1Q9H8G2 361 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 DMRT3Q9NQL9 472 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.48□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 AHRRA9YTQ3 701 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 ZNF185O15231 689 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 ZEB2O60315 1214 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 RECQL4O94761 1208 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 GYPEP15421 78 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 KRT4P19013 534 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 ENPP1P22413 925 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 SESN3P58005 492 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 STAT4Q14765 748 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 VPS72Q15906 364 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 TAF7LQ5H9L4 462 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 TOR2AQ5JU69 321 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 MRGPREQ86SM8 312 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 SYT12Q8IV01 421 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 OR52N2Q8NGI0 321 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 PROKR1Q8TCW9 393 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 RAMP2O60895 175 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 ULK1O75385 1050 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 NCR1O76036 304 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 OSMP13725 252 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 HSD3B2P26439 372 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 SOX5P35711 763 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 NHLH2Q02577 135 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 CCDC178Q5BJE1 867 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 MFSD14BQ5SR56 506 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 SYNE4Q8N205 404 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 GPR150Q8NGU9 434 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 TSPEARQ8WU66 669 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 NDC1Q9BTX1 674 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 LDAHQ9H6V9 325 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 GPRC5DQ9NZD1 345 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF404-202ENST00000587539 UNC119BA6NIH7 251 aa3.46□□□□□ -1.86
ZNF404-202ENST00000587539 NDUFA10O95299 355 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms