RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583444.1

SLC16A3-218, Transcript of solute carrier family 16 member 3, humanhuman

Gene SLC16A3, Length 2,882 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A3-218ENST00000583444 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PHF2O75151 1096 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 RARAP10276 462 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 MGARPQ8TDB4 240 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CNTNAP1P78357 1384 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 PAEPP09466 180 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 BCRP11274 1271 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 SCTRP47872 440 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 GPC5P78333 572 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 DLGAP5Q15398 846 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 FAM151AQ8WW52 585 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC16A3-218ENST00000583444 NFIBO00712 420 aa20.58■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 CCDC172P0C7W6 258 aa20.58■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ADCY1Q08828 1119 aa20.58■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 LONRF1Q17RB8 773 aa20.58■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 NUP85Q9BW27 656 aa20.58■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 CLDN3O15551 220 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 SPOPO43791 374 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ACSL3O95573 720 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 KCNA3P22001 575 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 MAP2K2P36507 400 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 NFIL3Q16649 462 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 UGCGQ16739 394 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 LDHDQ86WU2 507 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 OGFOD1Q8N543 542 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 C5orf60A6NFR6 353 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 SMTNP53814 917 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 PEX3P56589 373 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 FAM228AQ86W67 206 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 USP20Q9Y2K6 914 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 TMX2Q9Y320 296 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 POTEAQ6S8J7 498 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 CCT6BQ92526 530 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 NUDT17P0C025 328 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 VPS41P49754 854 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 FUKQ8N0W3 1084 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 CPXCR1Q8N123 301 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 CEP83Q9Y592 693 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 STK24Q9Y6E0 443 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ATP8B3O60423 1300 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 TP73O15350 636 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 MMP13P45452 471 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 MXI1P50539 228 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 FMO1Q01740 532 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 HVCN1Q96D96 273 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 CLGNO14967 610 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 CTNNA2P26232 953 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 ZNF653Q96CK0 615 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 FAM187AA6NFU0 413 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC16A3-218ENST00000583444 RIPK2O43353 540 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms