RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 PPFIA1Q13136 1202 aa19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 KAT2BQ92831 832 aa19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 TATDN2Q93075 761 aa19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 CCDC51Q96ER9 411 aa19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 GJB1P08034 283 aa19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ADCY2Q08462 1091 aa19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 LINC01465Q8N7H1 131 aa19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ABHD10Q9NUJ1 306 aa19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 USP20Q9Y2K6 914 aa19.19■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 TMCO5BA8MYB1 307 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 MAPK13O15264 365 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 STX10O60499 249 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 PIGRP01833 764 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 LIG4P49917 911 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 EFNA5P52803 228 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 BFSP1Q12934 665 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 GRIK4Q16099 956 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 MTHFD1LQ6UB35 978 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 GBP6Q6ZN66 633 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 POMGNT1Q8WZA1 660 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 IQCDQ96DY2 449 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 CRACR2AQ9BSW2 395 aa19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 GOLGA8IPA6NC78 632 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 GOLGA8JA6NMD2 632 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 EFCAB8A8MWE9 144 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 EPHB6O15197 1021 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ASAP2O43150 1006 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 SASH3O75995 380 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 GARTP22102 1010 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 BEX3Q00994 111 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 MARCH8Q5T0T0 291 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 A0A1W2PQJ5 194 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 NEFHP12036 1026 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ELF1P32519 619 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 TRIM32Q13049 653 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 KIAA0753Q2KHM9 967 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 OR8K1Q8NGG5 319 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 CD99L2Q8TCZ2 262 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 SAAL1Q96ER3 474 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 FBXL18Q96ME1 805 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ETAA1Q9NY74 926 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 STYXL1Q9Y6J8 313 aa19.17■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 USP27XA6NNY8 438 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 EDN1P05305 212 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 KRT13P13646 458 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 TFDP1Q14186 410 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 CBWD2Q8IUF1 395 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 NLRP4Q96MN2 994 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 CCDC113Q9H0I3 377 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 C2orf40Q9H1Z8 148 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 SETD4Q9NVD3 440 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 SRRDQ9UH36 339 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 RRN3P2A6NIE6 340 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ARHGAP6O43182 974 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 MSCO60682 206 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 FECHP22830 423 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 TMOD1P28289 359 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 CHMP4BP1P59074 171 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ZBED6P86452 979 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 CRYMQ14894 314 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 DNAJC7Q99615 494 aa19.16■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 GPR25O00155 361 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 HAS3O00219 553 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ERLIN2O94905 339 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ADRB2P07550 413 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 MYL3P08590 195 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 TRIM49P0CI25 452 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 TRIM49CP0CI26 452 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 HOXD10P28358 340 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 KCNJ6P48051 423 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 VAMP7P51809 220 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 PTENP60484 403 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 MICALL1Q8N3F8 863 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 EVPLQ92817 2033 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 CENPFP49454 3210 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 SEPT4O43236 478 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 NOL4O94818 638 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 ELNP15502 786 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 FMO5P49326 533 aa19.15■□□□□ 0.66
GDE1-203ENST00000564172 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms