RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557403.5

RBM23-229, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-229	ENST00000557403	ADAM15	Q13444	863 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CUL4A	Q13619	759 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	TMC7	Q7Z402	723 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	EFHB	Q8N7U6	833 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	TMEM169	Q96HH4	297 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	MYH11	P35749	1972 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	HIDE1	A8MVS5	230 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	DDHD2	O94830	711 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	EYA4	O95677	639 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PRKCB	P05771	671 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	GALT	P07902	379 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NAMPT	P43490	491 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	SLC11A1	P49279	550 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	DUSP6	Q16828	381 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	KCNK18	Q7Z418	384 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	HACE1	Q8IYU2	909 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	KIFAP3	Q92845	792 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	IFT74	Q96LB3	600 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	GAD1	Q99259	594 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PLIN2	Q99541	437 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CD207	Q9UJ71	328 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	DNM3	Q9UQ16	869 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	FAM50B	Q9Y247	325 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	USP20	Q9Y2K6	914 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ARL5C	A6NH57	179 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	N4BP3	O15049	544 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	MBTPS2	O43462	519 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	EDN1	P05305	212 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	AKAP5	P24588	427 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	SCNN1G	P51170	649 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	MAPK6	Q16659	721 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	BRAP	Q7Z569	592 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	VPS52	Q8N1B4	723 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	IGSF21	Q96ID5	467 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ZFP42	Q96MM3	310 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ZBP1	Q9H171	429 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	FZD8	Q9H461	694 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	KLK14	Q9P0G3	267 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CLEC1B	Q9P126	229 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PARP2	Q9UGN5	583 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403		A0A1B0GUA9	196 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	FSD2	A1L4K1	749 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	CARNS1	A5YM72	827 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	CCDC169	A6NNP5	214 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	HIP1R	O75146	1068 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	PDC	P20941	246 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	OR1G1	P47890	313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	PEX3	P56589	373 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	FAM187B	Q17R55	369 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-229	ENST00000557403	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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