RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555676.5

RBM23-216, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 4

Gene RBM23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-216	ENST00000555676	CSPG5	O95196	566 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	ITGB1	P05556	798 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	TPM3	P06753	285 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	BMP1	P13497	986 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	CYP11B2	P19099	503 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	DNAJB1	P25685	340 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	RARRES1	P49788	294 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	CAMK1	Q14012	370 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	P2RX5	Q93086	422 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	CASD1	Q96PB1	797 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	CWH43	Q9H720	699 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM23-216	ENST00000555676	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	ASAP2	O43150	1006 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	IDE	P14735	1019 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	SPAG1	Q07617	926 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	PAK1	Q13153	545 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	NCAPH	Q15003	741 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	LRRC15	Q8TF66	581 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	TTC28	Q96AY4	2481 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	DGAT1	O75907	488 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	ADCY5	O95622	1261 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	EOMES	O95936	686 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	SCP2	P22307	547 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	CASP1	P29466	404 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	ABCD1	P33897	745 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	ARL2	P36404	184 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	PRCP	P42785	496 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	PHKA2	P46019	1235 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	EHHADH	Q08426	723 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	GIT2	Q14161	759 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	POF1B	Q8WVV4	589 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	LPP	Q93052	612 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	CDC25B	P30305	580 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	IRS1	P35568	1242 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	CAPS	Q13938	189 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM23-216	ENST00000555676	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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