RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554340.1

NEMP1-204, Transcript of nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEMP1, Length 1,381 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1-204ENST00000554340 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.72■■□□□ 1.23
NEMP1-204ENST00000554340 POTEMA6NI47 508 aa22.71■■□□□ 1.23
NEMP1-204ENST00000554340 C2CD2LO14523 706 aa22.71■■□□□ 1.23
NEMP1-204ENST00000554340 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.71■■□□□ 1.23
NEMP1-204ENST00000554340 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.71■■□□□ 1.23
NEMP1-204ENST00000554340 ERMNQ8TAM6 284 aa22.71■■□□□ 1.23
NEMP1-204ENST00000554340 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.71■■□□□ 1.23
NEMP1-204ENST00000554340 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NEMP1-204ENST00000554340 MIOSQ9NXC5 875 aa22.71■■□□□ 1.23
NEMP1-204ENST00000554340 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.71■■□□□ 1.23
NEMP1-204ENST00000554340 B4GALT5O43286 388 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 NR1I2O75469 434 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 ADH1AP07327 375 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 GLUD2P49448 558 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 NUBP1P53384 320 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 ST3GAL1Q11201 340 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 APOL6Q9BWW8 343 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 KIF3AQ9Y496 699 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.69■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.69■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.69■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.69■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.69■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.69■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 A0A087WWV3 80 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 A0A1B0GUA9 196 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 TEX28O15482 410 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 NPTXRO95502 500 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 TRAPPC10P48553 1259 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 DSG1Q02413 1049 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 NACC1Q96RE7 527 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.68■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 F8W810 466 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 GLUD1P00367 558 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 OR52Z1P0C646 297 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 AKAP5P24588 427 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 C8orf34Q49A92 452 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 CHST7Q9NS84 486 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 DPP7Q9UHL4 492 aa22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.66■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 ST18O60284 1047 aa22.66■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 GRIK3Q13003 919 aa22.66■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 RABEP1Q15276 862 aa22.66■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF174Q15697 407 aa22.66■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.66■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.66■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.66■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 MED24O75448 989 aa22.65■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 TTC38Q5R3I4 469 aa22.65■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 FUT10Q6P4F1 479 aa22.65■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.65■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 GPR65Q8IYL9 337 aa22.65■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 STK24Q9Y6E0 443 aa22.65■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 C1RP00736 705 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 MUTP22033 750 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 FAM187BQ17R55 369 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 KIF2CQ99661 725 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 RAB34Q9BZG1 259 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 FZD8Q9H461 694 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 KLK14Q9P0G3 267 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 PARP2Q9UGN5 583 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.64■■□□□ 1.22
NEMP1-204ENST00000554340 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.64■■□□□ 1.21
NEMP1-204ENST00000554340 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.63■■□□□ 1.21
NEMP1-204ENST00000554340 RPA1P27694 616 aa22.63■■□□□ 1.21
NEMP1-204ENST00000554340 TDGQ13569 410 aa22.63■■□□□ 1.21
NEMP1-204ENST00000554340 USP41Q3LFD5 358 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms