RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508350.1

CDH18-208, Transcript of cadherin 18, human

TSL 4

Gene CDH18, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDH18-208	ENST00000508350	SYK	P43405	635 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	CASP5	P51878	434 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ASIC1	P78348	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	KCNA1	Q09470	495 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	CUL4B	Q13620	913 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	TFDP1	Q14186	410 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ZNF787	Q6DD87	383 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ZBTB33	Q86T24	672 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	FAM161B	Q96MY7	647 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	FZD8	Q9H461	694 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	EPOP	A6NHQ4	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350		K7ENM7	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350		K7ERI5	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	RFXAP	O00287	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ACKR2	O00590	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	TLL1	O43897	1013 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	KLRC4	O43908	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ERLIN2	O94905	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	GJB5	O95377	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	S1PR4	O95977	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	CA3	P07451	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	RFX1	P22670	979 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	AKAP5	P24588	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	HOXD13	P35453	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	GCGR	P47871	477 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ZNF131	P52739	623 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	FAM189B	P81408	668 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	COASY	Q13057	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	PNOC	Q13519	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	MAPK6	Q16659	721 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDH18-208	ENST00000508350	CEP120	Q8N960	986 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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