RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505870.5

GMDS-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 8,217 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-202ENST00000505870 RNF103O00237 685 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ANGPT2O15123 496 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 HNMTP50135 292 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 GPC3P51654 580 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 EFHC2Q5JST6 749 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 EHD2Q9NZN4 543 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NSD2O96028 1365 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 A0A0G2JND7 137 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ARF5P84085 180 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TNNI3KQ59H18 835 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ZMYM3Q14202 1370 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SMIM22K7EJ46 135 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 EYA2O00167 538 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CLDN3O15551 220 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NUDT14O95848 222 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 S100GP29377 79 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SNX17Q15036 470 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 STX12Q86Y82 276 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TAF4O00268 1085 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SLC27A2O14975 620 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NDUFS3O75489 264 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SLCO1A2P46721 670 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 AP2B1P63010 937 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TTLL4Q14679 1199 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 DDI1Q8WTU0 396 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 STOML1Q9UBI4 398 aa9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 RHOBTB1O94844 696 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NR1D1P20393 614 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 VSNL1P62760 191 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 LRRC24Q50LG9 513 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MPOP05164 745 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CES1P23141 567 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 GRK3P35626 688 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MACC1Q6ZN28 852 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 RIN3Q8TB24 985 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 STK33Q9BYT3 514 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 UVRAGQ9P2Y5 699 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ABCC5O15440 1437 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 USP17L12C9JPN9 530 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 USP17L21D6R901 530 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 KRT40Q6A162 431 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NLRP14Q86W24 1093 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 GFPT2O94808 682 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 AP1S2P56377 157 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TBC1D25Q3MII6 688 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MARK1Q9P0L2 795 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 KRT6AP02538 564 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 KRT6BP04259 564 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MMEP08473 750 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 KRT6CP48668 564 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MAPK6Q16659 721 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NUP85Q9BW27 656 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CD274Q9NZQ7 290 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CDC23Q9UJX2 597 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 F8W810 466 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 KRT16P08779 473 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CTSWP56202 376 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CSNK2BP67870 215 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 LPIN1Q14693 890 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MAPRE2Q15555 327 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GMDS-AS1-202ENST00000505870 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms