RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 PRKCBP05771 671 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FMO5P49326 533 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 VAMP7P51809 220 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PTENP60484 403 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MFSD10Q14728 455 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MAPK6Q16659 721 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 RDH13Q8NBN7 331 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TMC2Q8TDI7 906 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MFSD14AQ96MC6 490 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MAP7D2Q96T17 732 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PLCB1Q9NQ66 1216 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CEP72Q9P209 647 aa11.68□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PMM2O15305 246 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 P4HA2O15460 535 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ZEB2O60315 1214 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 NOL4O94818 638 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ADRB2P07550 413 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CLCN1P35523 988 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PHKA2P46019 1235 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CDC42EP1Q00587 391 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 BEX3Q00994 111 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SHHQ15465 462 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM187BQ17R55 369 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 USP37Q86T82 979 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SAAL1Q96ER3 474 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 NLRP4Q96MN2 994 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CRACR2AQ9BSW2 395 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FZD8Q9H461 694 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SPC25Q9HBM1 224 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SETD4Q9NVD3 440 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 AKT3Q9Y243 479 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.67□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 LTBP2Q14767 1821 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0B4J269 797 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF233A6NK53 670 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ACKR2O00590 384 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 EPHB6O15197 1021 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CCP110O43303 1012 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 EDN1P05305 212 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIM49P0CI25 452 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIM49CP0CI26 452 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 RARBP10826 455 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FOSL2P15408 326 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC9A1P19634 815 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PON1P27169 355 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CDK17Q00537 523 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MYL7Q01449 175 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MBTD1Q05BQ5 628 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CYP24A1Q07973 514 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MEA1Q16626 185 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PDXDC1Q6P996 788 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF410Q86VK4 478 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MYLIPQ8WY64 445 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 BAP1Q92560 729 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms