RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC27A1Q6PCB7 646 aa25.03■■□□□ 1.6
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TRDMT1-211ENST00000495022 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 SMOC2Q9H3U7 446 aa25.03■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 RXFP1Q9HBX9 757 aa25.03■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 MIOSQ9NXC5 875 aa25.03■■□□□ 1.6
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TRDMT1-211ENST00000495022 FAM186AA6NE01 2351 aa25.02■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 POTEMA6NI47 508 aa25.02■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 TEX28O15482 410 aa25.02■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 NEK4P51957 841 aa25.02■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 DSG1Q02413 1049 aa25.02■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.02■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 TAS1R1Q7RTX1 841 aa25.02■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 APOL6Q9BWW8 343 aa25.02■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.02■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 MAN1C1Q9NR34 630 aa25.02■■□□□ 1.6
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TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1B0GUA9 196 aa25.01■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 B4GALT5O43286 388 aa25.01■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 GLUD1P00367 558 aa25.01■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 C1RP00736 705 aa25.01■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR65Q8IYL9 337 aa25.01■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.01■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.01■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 COLEC11Q9BWP8 271 aa25.01■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 CHST7Q9NS84 486 aa25.01■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
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TRDMT1-211ENST00000495022 FOSBP53539 338 aa25■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 GRIK3Q13003 919 aa25■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 GSTCDQ8NEC7 633 aa25■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM60Q9H2L4 133 aa25■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP4R2Q9NY27 417 aa25■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 NPTXRO95502 500 aa24.99■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.99■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 SPTBN4Q9H254 2564 aa24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 F8W810 466 aa24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 PAPLNO95428 1278 aa24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 AKAP5P24588 427 aa24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM187BQ17R55 369 aa24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 FUT10Q6P4F1 479 aa24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.98■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa24.97■■□□□ 1.59
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TRDMT1-211ENST00000495022 A0A087WWV3 80 aa24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa24.97■■□□□ 1.59
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TRDMT1-211ENST00000495022 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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TRDMT1-211ENST00000495022 USP41Q3LFD5 358 aa24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM105Q8N8V8 129 aa24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 STAMQ92783 540 aa24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 NACC1Q96RE7 527 aa24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 MFSD1Q9H3U5 465 aa24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM86C1Q9NVL1 165 aa24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 FNIP2Q9P278 1114 aa24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 IGSF9Q9P2J2 1179 aa24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 DUSP12Q9UNI6 340 aa24.97■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP2B1P20020 1258 aa24.96■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 CREMQ03060 361 aa24.96■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.96■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.96■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.96■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 FZD8Q9H461 694 aa24.96■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.96■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNK12Q9HB15 430 aa24.96■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 PARP2Q9UGN5 583 aa24.96■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 MED24O75448 989 aa24.95■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.95■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 ERMNQ8TAM6 284 aa24.95■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 KLK14Q9P0G3 267 aa24.95■■□□□ 1.59
TRDMT1-211ENST00000495022 CLUHO75153 1309 aa24.95■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 H0Y858 1186 aa24.94■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 N4BP3O15049 544 aa24.94■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 ST18O60284 1047 aa24.94■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 RPA1P27694 616 aa24.94■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 RFPL2O75678 378 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 OR52Z1P0C646 297 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 GUCY1B3Q02153 619 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 TUSC3Q13454 348 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
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