RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 NT5DC1Q5TFE4 455 aa25.02■■□□□ 1.6
SENP6-211ENST00000493959 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.02■■□□□ 1.6
SENP6-211ENST00000493959 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SENP6-211ENST00000493959 FEZF2Q8TBJ5 459 aa25.02■■□□□ 1.6
SENP6-211ENST00000493959 SUSD6Q92537 303 aa25.02■■□□□ 1.6
SENP6-211ENST00000493959 KIFAP3Q92845 792 aa25.02■■□□□ 1.6
SENP6-211ENST00000493959 IFT74Q96LB3 600 aa25.02■■□□□ 1.6
SENP6-211ENST00000493959 SNTG2Q9NY99 539 aa25.02■■□□□ 1.6
SENP6-211ENST00000493959 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SENP6-211ENST00000493959 SFI1A8K8P3 1242 aa25.01■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 HIP1RO75146 1068 aa25.01■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 EPCAMP16422 314 aa25.01■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 PEX3P56589 373 aa25.01■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 PPP2R5AQ15172 486 aa25.01■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 PTPN14Q15678 1187 aa25.01■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.01■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.01■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 IRAK3Q9Y616 596 aa25.01■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 FSD2A1L4K1 749 aa25■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 LILRB3O75022 631 aa25■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 MAPK7Q13164 816 aa25■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 RNF135Q8IUD6 432 aa25■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 HACE1Q8IYU2 909 aa25■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 SLC22A17Q8WUG5 538 aa25■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 CASP10Q92851 521 aa25■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 CARNS1A5YM72 827 aa24.99■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 CCDC169A6NNP5 214 aa24.99■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 N4BP3O15049 544 aa24.99■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 EFEMP2O95967 443 aa24.99■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 CNPP09543 421 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 WEE2P0C1S8 567 aa24.99■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 NPTX2P47972 431 aa24.99■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.99■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 KLHL5Q96PQ7 755 aa24.99■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 MUTYHQ9UIF7 546 aa24.99■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 LOC730098B7Z3J9 87 aa24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 C2CD2LO14523 706 aa24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 SRGAP2BP0DMP2 458 aa24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 EFNA5P52803 228 aa24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 GRIN1Q05586 938 aa24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 TMEM31Q5JXX7 168 aa24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 HYIQ5T013 277 aa24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 MYO10Q9HD67 2058 aa24.98■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 TRIP11Q15643 1979 aa24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 K7ERI5 159 aa24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 DCXO43602 365 aa24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 GPR37L1O60883 481 aa24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 ALADP13716 330 aa24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 B3GALT6Q96L58 329 aa24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 GDAQ9Y2T3 454 aa24.97■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 PTGESO14684 152 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 RECQL4O94761 1208 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 SOD2P04179 222 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 GIT2Q14161 759 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 KIAA0319Q5VV43 1072 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 LRRC15Q8TF66 581 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 COLEC11Q9BWP8 271 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP6-211ENST00000493959 SLC16A4O15374 487 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 KLRC2P26717 231 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 SLC12A3P55017 1021 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 GRIK3Q13003 919 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 CABP7Q86V35 215 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 ADAM7Q9H2U9 754 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 TECTAO75443 2155 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 PLA2G4BP0C869 781 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 MYBP10242 640 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 ARSHQ5FYA8 562 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 BRAPQ7Z569 592 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP6-211ENST00000493959 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms