RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490500.5

RBBP4-213, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-213	ENST00000490500	AKAP5	P24588	427 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	GLUD2	P49448	558 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	GLUD1	P00367	558 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	C1R	P00736	705 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CLCN5	P51795	746 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	TDG	Q13569	410 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	FZD8	Q9H461	694 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	ST18	O60284	1047 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	GFRA3	O60609	400 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	MED24	O75448	989 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	NR1I2	O75469	434 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	RFPL2	O75678	378 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	NPTXR	O95502	500 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	NPR3	P17342	541 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	NEK4	P51957	841 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	FOSB	P53539	338 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	GRIK3	Q13003	919 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	HACE1	Q8IYU2	909 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	TGM5	O43548	720 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	MYB	P10242	640 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	MCM7	P33993	719 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	TRIM29	Q14134	588 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CLUH	O75153	1309 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	PI15	O43692	258 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CYP11B2	P19099	503 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	NACC1	Q96RE7	527 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	MYADM	Q96S97	322 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBBP4-213	ENST00000490500	PTGES	O14684	152 aa		13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms