RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CPB2	Q96IY4	423 aa		19.06	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		19.06	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	19.06	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		19.06	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		19.06	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		19.06	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	ARID2	Q68CP9	1835 aa		19.06	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	SOD2	P04179	222 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	GUCY2C	P25092	1073 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIK3	Q13003	919 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNN1	Q92952	543 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	DRC1	Q96MC2	740 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	GAD1	Q99259	594 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF39	Q9H2S5	420 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		19.05	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087WWV3	80 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR33	A8MZF0	331 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	B4GALT5	O43286	388 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	POMC	P01189	267 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKCB	P05771	671 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPN14	Q15678	1187 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	IL17A	Q16552	155 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	LONRF3	Q496Y0	759 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	CES5A	Q6NT32	575 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	GBP3	Q9H0R5	595 aa		19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	19.04	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	B4GALT3	O60512	393 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	NPTXR	O95502	500 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	MLH1	P40692	756 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	MTHFR	P42898	656 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	ATL3	Q6DD88	541 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	BSND	Q8WZ55	320 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	CHST7	Q9NS84	486 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		19.03	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424		K7ERI5	159 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	PAPLN	O95428	1278 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	F13A1	P00488	732 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	SCNN1G	P51170	649 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	CREM	Q03060	361 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF135	Q8IUD6	432 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP42	Q96MM3	310 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	MIOS	Q9NXC5	875 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP45	Q9UL16	551 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	HES2	Q9Y543	173 aa		19.02	■□□□□ 0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	DSG1	Q02413	1049 aa		19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	TUSC3	Q13454	348 aa		19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	MARCH5	Q9NX47	278 aa		19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	FNIP2	Q9P278	1114 aa		19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	UST	Q9Y2C2	406 aa		19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	NR2E1	Q9Y466	385 aa		19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424		E9PMD0	336 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YCG3	227 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	UROD	P06132	367 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	TH	P07101	528 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ADH1A	P07327	375 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1G1	P47890	313 aa		19	■□□□□ 0.63

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