RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482016.5

CGGBP1-206, Transcript of CGG triplet repeat binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CGGBP1, Length 1,147 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1-206ENST00000482016 COLEC11Q9BWP8 271 aa30.01■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 KLK14Q9P0G3 267 aa30.01■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 USTQ9Y2C2 406 aa30.01■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa30.01■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 MYO10Q9HD67 2058 aa30■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 F8W810 466 aa30■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 GLUD2P49448 558 aa30■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 ERMNQ8TAM6 284 aa30■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 SMOC2Q9H3U7 446 aa30■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 A0A1B0GUA9 196 aa29.99■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 ADH1AP07327 375 aa29.99■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 MYBP10242 640 aa29.99■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 AVPR2P30518 371 aa29.99■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 TMEM132AQ24JP5 1023 aa29.99■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 POTEGQ6S5H5 508 aa29.99■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 CCDC149Q6ZUS6 474 aa29.99■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa29.99■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 MAN1C1Q9NR34 630 aa29.99■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 TEX28O15482 410 aa29.98■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 OR52Z1P0C646 297 aa29.98■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 KIAA0319Q5VV43 1072 aa29.97■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 RABGGTAQ92696 567 aa29.97■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 B3GALT6Q96L58 329 aa29.97■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 ARHGEF35A5YM69 484 aa29.96■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 LIG1P18858 919 aa29.96■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa29.96■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 PADI6Q6TGC4 694 aa29.96■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 OTOP3Q7RTS5 596 aa29.96■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.96■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 GSTCDQ8NEC7 633 aa29.96■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 PRIMPOLQ96LW4 560 aa29.96■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 PHOX2BQ99453 314 aa29.96■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 DPP7Q9UHL4 492 aa29.96■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 GLUD1P00367 558 aa29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 RPA1P27694 616 aa29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 RBM25P49756 843 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 DSG1Q02413 1049 aa29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 TCF15Q12870 199 aa29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 GRIK3Q13003 919 aa29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 TTC38Q5R3I4 469 aa29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 C2orf40Q9H1Z8 148 aa29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 FZD8Q9H461 694 aa29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 RXFP1Q9HBX9 757 aa29.95■■■□□ 2.39
CGGBP1-206ENST00000482016 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 TADA2AO75478 443 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 EFEMP2O95967 443 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 SPATA31D3P0C874 917 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 FUT10Q6P4F1 479 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 PALB2Q86YC2 1186 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 GPR62Q9BZJ7 368 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 CHST7Q9NS84 486 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 CACNG4Q9UBN1 327 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 ADAM28Q9UKQ2 775 aa29.94■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 KMT2EQ8IZD2 1858 aa29.93■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 CYP11B2P19099 503 aa29.93■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 MAPK6Q16659 721 aa29.93■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 USP41Q3LFD5 358 aa29.93■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 GLYCTKQ8IVS8 523 aa29.93■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 BSNDQ8WZ55 320 aa29.93■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 USP20Q9Y2K6 914 aa29.93■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 TTLL13PA6NNM8 815 aa29.92■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 N4BP3O15049 544 aa29.92■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 FAM187BQ17R55 369 aa29.92■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 NOSTRINQ8IVI9 506 aa29.92■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 DEPTORQ8TB45 409 aa29.92■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 PDZD7Q9H5P4 517 aa29.92■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 POLD4Q9HCU8 107 aa29.92■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 SNTG2Q9NY99 539 aa29.92■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 RFPL2O75678 378 aa29.91■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 PRKCBP05771 671 aa29.91■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 HAUS3Q68CZ6 603 aa29.91■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 MFSD1Q9H3U5 465 aa29.91■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 NAMPTP43490 491 aa29.9■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 NBR1Q14596 966 aa29.9■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 PAAF1Q9BRP4 392 aa29.9■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 ADPGKQ9BRR6 497 aa29.9■■■□□ 2.38
CGGBP1-206ENST00000482016 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms