RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 TISP43B9A030 160 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 OGTO15294 1046 aa10.25□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 EXTL3O43909 919 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 NBNO60934 754 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CXCL10P02778 98 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PFKMP08237 780 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 EPB41P11171 864 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 SKIP12755 728 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB27AP51159 221 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP2J2P51589 502 aa10.25□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 SPAG1Q07617 926 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP135Q66GS9 1140 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 MFSD5Q6N075 450 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB33Q86T24 672 aa10.25□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.25□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa10.25□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 MED15Q96RN5 788 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CDT1Q9H211 546 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 IKZF4Q9H2S9 585 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PCIF1Q9H4Z3 704 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF233A6NK53 670 aa10.24□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 MAPK13O15264 365 aa10.24□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.772e-11■■□□□ 12.3
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SH3BP4-208ENST00000462602 GPNMBQ14956 572 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 NCAPHQ15003 741 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 EEF1DP3Q658K8 133 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC55Q6ZSA7 311 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 USP37Q86T82 979 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 LUZP1Q86V48 1076 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 GAS2L3Q86XJ1 694 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF214Q8ND24 703 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXL18Q96ME1 805 aa10.24□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 TMX1Q9H3N1 280 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf112Q9NSG2 853 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 FANCLQ9NW38 375 aa10.24□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.24□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF623O75123 536 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 AKAP3O75969 853 aa10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 STAG3L1P0CL83 205 aa10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 GRM5P41594 1212 aa10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 FRMD5Q7Z6J6 570 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP4-208ENST00000462602 THNSL1Q8IYQ7 743 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 RDH13Q8NBN7 331 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PGBD4Q96DM1 585 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 SAAL1Q96ER3 474 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 EEF2KMTQ96G04 330 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 ACAP3Q96P50 834 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 HAPLN2Q9GZV7 340 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 RBSNQ9H1K0 784 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 RGS18Q9NS28 235 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM105AQ9NUU6 356 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 BRCA2P51587 3418 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA8IPA6NC78 632 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA8JA6NMD2 632 aa10.22□□□□□ -0.77
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