RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328020.10

CMTM1-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 981 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-201ENST00000328020 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
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CMTM1-201ENST00000328020 ZBTB33Q86T24 672 aa15.39■□□□□ 0.05
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CMTM1-201ENST00000328020 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.39■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 TOP1MTQ969P6 601 aa15.39■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa15.39■□□□□ 0.05
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CMTM1-201ENST00000328020 BICDL2A1A5D9 508 aa15.38■□□□□ 0.05
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CMTM1-201ENST00000328020 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.38■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 IPPQ9Y573 584 aa15.38■□□□□ 0.05
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CMTM1-201ENST00000328020 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 EDN1P05305 212 aa15.37■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 CLTAP09496 248 aa15.37■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 GRM5P41594 1212 aa15.37■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 PRCPP42785 496 aa15.37■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 MYBPC2Q14324 1141 aa15.37■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.37■□□□□ 0.05
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CMTM1-201ENST00000328020 ACAP3Q96P50 834 aa15.37■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 YME1L1Q96TA2 773 aa15.37■□□□□ 0.05
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CMTM1-201ENST00000328020 TLL1O43897 1013 aa15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 GJB5O95377 273 aa15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 NLRP12P59046 1061 aa15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 DEFB103AP81534 67 aa15.36■□□□□ 0.05
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CMTM1-201ENST00000328020 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 THNSL1Q8IYQ7 743 aa15.36■□□□□ 0.05
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CMTM1-201ENST00000328020 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15.36■□□□□ 0.05
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CMTM1-201ENST00000328020 APOL6Q9BWW8 343 aa15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 TMEM117Q9H0C3 514 aa15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 RSAD1Q9HA92 442 aa15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 ANO10Q9NW15 660 aa15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.36■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 CITO14578 2027 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 ABLIM1O14639 778 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 TGFB1I1O43294 461 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 EXTL3O43909 919 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 HOXD13P35453 343 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 PAK1Q13153 545 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 RAB30Q15771 203 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 STX1AQ16623 288 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 FAM117BQ6P1L5 589 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 SLC39A4Q6P5W5 647 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 CD302Q8IX05 232 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 GPD1LQ8N335 351 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 XXYLT1Q8NBI6 393 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.35■□□□□ 0.05
CMTM1-201ENST00000328020 P2RX5Q93086 422 aa15.35■□□□□ 0.05
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