RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 C2CD2LO14523 706 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 B4GALT5O43286 388 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 NPTXRO95502 500 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 OR52Z1P0C646 297 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 AKAP5P24588 427 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 MTMR3Q13615 1198 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 PARP2Q9UGN5 583 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 ADH1AP07327 375 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 GLUD2P49448 558 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 FAM187BQ17R55 369 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 FZD8Q9H461 694 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 EFEMP2O95967 443 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 MUTP22033 750 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 TRAPPC10P48553 1259 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 PTPN5P54829 565 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 TTC38Q5R3I4 469 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 IER5LQ5T953 404 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 PADI6Q6TGC4 694 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 CYP11B2P19099 503 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 DSG1Q02413 1049 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 GRIK3Q13003 919 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 POTEGQ6S5H5 508 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 CHST7Q9NS84 486 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 KLK14Q9P0G3 267 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 N4BP3O15049 544 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 TEX28O15482 410 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 BRD1O95696 1058 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 C1RP00736 705 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 AVPR2P30518 371 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 MRE11P49959 708 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 MAPK6Q16659 721 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 USP41Q3LFD5 358 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 GPR65Q8IYL9 337 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 PRSS33Q8NF86 280 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.321e-6■■■□□ 15.3
NEDD8-201ENST00000250495 TADA2AO75478 443 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 GLUD1P00367 558 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 NAMPTP43490 491 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 PPP2R5AQ15172 486 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 FUT10Q6P4F1 479 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 STK24Q9Y6E0 443 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-201ENST00000250495 ACKR2O00590 384 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 ASGR2P07307 311 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 PDIA5Q14554 519 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 DEPTORQ8TB45 409 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 F8W810 466 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 PRKCBP05771 671 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 NUBP1P53384 320 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 VCPP55072 806 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 CREMQ03060 361 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 TUSC3Q13454 348 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 BSNDQ8WZ55 320 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 IFT74Q96LB3 600 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 RAB34Q9BZG1 259 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-201ENST00000250495 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.25■■□□□ 1.31
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