RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc1a1P51906 523 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gtf2bP62915 316 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr41Q3UDP0 460 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krt12Q64291 487 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SpopQ6ZWS8 374 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bpifb9aQ80XI7 591 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zmynd10Q99ML0 440 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgef25Q9CWR0 618 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam205a1D3YZF6 1314 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clrn2B2RVW2 232 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myo1eE9Q634 1107 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NppbP40753 121 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GssP51855 474 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abi2P62484 446 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Jdp2P97875 163 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trmt1Q3TX08 663 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rufy4Q3TYX8 563 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AgpsQ8C0I1 645 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mill1Q8HWE7 395 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spire2Q8K1S6 718 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fkbp6Q91XW8 327 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nudt12Q9DCN1 462 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cnga3Q9JJZ8 631 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sned1Q70E20 1403 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bpifb5Q3UQ05 490 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mtus1Q5HZI1 1210 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pla2g4cQ64GA5 597 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kctd6Q8BNL5 237 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gprasp2Q8BUY8 826 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpihbp1Q9D1N2 228 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp29Q9ES63 869 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Unc13dB2RUP2 1085 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4933406M09RikG3XA12 479 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xrcc5P27641 732 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccnd2P30280 289 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vars2Q3U2A8 1060 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FancbQ5XJY6 703 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AlcamQ61490 583 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sp4Q62445 782 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nyap1Q6PFX7 833 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ntrk3Q6VNS1 825 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfml3Q8BK62 406 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rint1Q8BZ36 792 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C130026I21RikQ8C898 291 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rtp1Q8C8C1 263 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ItpkaQ8R071 459 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhb12Q91Y07 789 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Txnrd2Q9JLT4 524 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Net1Q9Z206 595 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf804aA2AKY4 1200 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptprn2P80560 1001 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 E2f8Q58FA4 860 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vps41Q5KU39 853 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Daam2Q80U19 1115 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Epc2Q8C0I4 808 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd9Q8C726 612 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sugp2Q8CH09 1067 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mcur1Q9CXD6 340 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbm31yQ9D3U4 565 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttll6A4Q9E8 822 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr552E9Q545 317 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Flot1O08917 428 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdc25cP48967 447 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CtshP49935 333 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SpertQ32MG2 446 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Palb2Q3U0P1 1104 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sema5aQ62217 1077 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnajc8Q6NZB0 253 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Actl9Q8CG27 415 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf654Q9DAU9 571 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gtf2ird1Q9JI57 1104 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rfwd2Q9R1A8 733 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atrnl1Q6A051 1378 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wnt7bP28047 349 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Drc1Q3USS3 753 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dusp4Q8BFV3 398 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pih1h3bQ8C6P5 218 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc14Q8VC16 493 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vps36Q91XD6 386 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tjp3Q9QXY1 905 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ggt5Q9Z2A9 573 aa18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Irf8P23611 424 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Erbb2P70424 1256 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rassf9Q8K342 435 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 6030498E09RikB1AX85 169 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm15448F6PZL4 682 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pitpnm1O35954 1243 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc125Q5U465 500 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcf3Q8K268 709 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 IkbipQ9DBZ1 373 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prdm15E9Q8T2 1174 aa18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rap1gds1E9Q912 607 aa18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Frg1P97376 258 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.3 ms