RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	GIPC2	Q8TF65	315 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TTLL1	O95922	423 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	SPDYE6	P0CI01	402 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	MCAM	P43121	646 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	COPS2	P61201	443 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	KRT17	Q04695	432 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	DLGAP5	Q15398	846 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	CEP55	Q53EZ4	464 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	NCLN	Q969V3	563 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	SNF8	Q96H20	258 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362		B2RBV5	119 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	OAT	P04181	439 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	PEX3	P56589	373 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	IGBP1	P78318	339 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	COASY	Q13057	564 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	STAT4	Q14765	748 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC18A3	Q16572	532 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	C8orf37	Q96NL8	207 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	KPNA7	A9QM74	516 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	KYNU	Q16719	465 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	APOL6	Q9BWW8	343 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	SENP1	Q9P0U3	644 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	PXDN	Q92626	1479 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	APOA1	P02647	267 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM49	P0CI25	452 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM49C	P0CI26	452 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	CPA2	P48052	419 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TFDP2	Q14188	446 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TEX9	Q8N6V9	391 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC17	Q96LX7	622 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	NEDD4	P46934	1319 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	PSMD14	O00487	310 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	ARHGEF9	O43307	516 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	ADCY3	O60266	1144 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	CHEK2	O96017	543 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	MTM1	Q13496	603 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	DGKH	Q86XP1	1220 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC13	Q8NBP0	860 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	EME1	Q96AY2	570 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM15	Q9C019	465 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	SNX25	Q9H3E2	840 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	STK36	Q9NRP7	1315 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF233	A6NK53	670 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	NPR1	P16066	1061 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	TYK2	P29597	1187 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	POU5F1B	Q06416	359 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC29A2	Q14542	456 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	KLC3	Q6P597	504 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	AURKC	Q9UQB9	309 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	PAPPA	Q13219	1627 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	POTEB3	A0JP26	581 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	POTEC	B2RU33	542 aa		12.42	□□□□□ -0.42
FAM200B-223	ENST00000622362	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42

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