RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614428.4

ACACA-231, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACACA, Length 9,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-231	ENST00000614428	MAML3	Q96JK9	1138 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	RIT2	Q99578	217 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	POTEB3	A0JP26	581 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	POTEC	B2RU33	542 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	HYI	Q5T013	277 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	MFSD5	Q6N075	450 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	WDR59	Q6PJI9	974 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	POTEB	Q6S5H4	581 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	COPS2	P61201	443 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	NME8	Q8N427	588 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PICK1	Q9NRD5	415 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	DONSON	Q9NYP3	566 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF185	O15231	689 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC22	O60826	627 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ASNS	P08243	561 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SREBF1	P36956	1147 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	LPAR1	Q92633	364 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	TCHP	Q9BT92	498 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ESYT3	A0FGR9	886 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF233	A6NK53	670 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	RASSF10	A6NK89	507 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	RASA1	P20936	1047 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	VAMP7	P51809	220 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PPP2R5C	Q13362	524 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	EMC10	Q5UCC4	262 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	POTEG	Q6S5H5	508 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	FAM167A	Q96KS9	214 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	TM9SF1	O15321	606 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF844	Q08AG5	666 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	GMCL1	Q96IK5	515 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	FAM205C	A6NFA0	338 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CA4	P22748	312 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PON1	P27169	355 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	AGPAT1	Q99943	283 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	DAPK3	O43293	454 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CYP3A7	P24462	503 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	HIF1A	Q16665	826 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CFAP69	A5D8W1	941 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ACADS	P16219	412 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	NFIL3	Q16649	462 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SP8	Q8IXZ3	490 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	SENP2	Q9HC62	589 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PARVA	Q9NVD7	372 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	AMACR	Q9UHK6	382 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CHGB	P05060	677 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PSAP	P07602	524 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	PDP2	Q9P2J9	529 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ACACA-231	ENST00000614428	CHN1	P15882	459 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	GALC	P54803	685 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	AP2B1	P63010	937 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF398	Q8TD17	642 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	LXN	Q9BS40	222 aa		7.09	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.28

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