RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598913.5

SAMD4B-208, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD4B, Length 2,877 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4B-208ENST00000598913 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.46■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.46■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 CES2O00748 559 aa24.46■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 DHX15O43143 795 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 ENTPD3O75355 529 aa24.46■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 ADSSP30520 456 aa24.46■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.46■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 O00370 1275 aa24.45■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 SPOPO43791 374 aa24.45■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 EGFRP00533 1210 aa24.45■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 SLC15A2Q16348 729 aa24.45■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 FAM182AQ5T1J6 154 aa24.45■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 DUPD1Q68J44 220 aa24.45■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 MGARPQ8TDB4 240 aa24.45■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.45■■□□□ 1.51
SAMD4B-208ENST00000598913 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.45■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 GMNCA6NCL1 334 aa24.45■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 FAM107AO95990 144 aa24.45■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CREB1P16220 341 aa24.45■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 MXI1P50539 228 aa24.45■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 EPS8L1Q8TE68 723 aa24.45■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 NUP85Q9BW27 656 aa24.45■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 TRPC6Q9Y210 931 aa24.45■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 ZNF536O15090 1300 aa24.45■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CLDN3O15551 220 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 GJC1P36383 396 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 XKR9Q5GH70 373 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 KIF22Q14807 665 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 LRRC14Q15048 493 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 HERPUD2Q9BSE4 406 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CNTNAP1P78357 1384 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 GJB6O95452 261 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CAP2P40123 477 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 PMS2P54278 862 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 BSNDQ8WZ55 320 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 ZNF653Q96CK0 615 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 GRHL1Q9NZI5 618 aa24.44■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 BCRP11274 1271 aa24.43■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 KRT5P13647 590 aa24.43■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 TKFCQ3LXA3 575 aa24.43■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.43■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.43■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 STRA6Q9BX79 667 aa24.43■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.43■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CARD9Q9H257 536 aa24.43■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 INTUQ9ULD6 942 aa24.43■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.43■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 RPTORQ8N122 1335 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 DNM1LO00429 736 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 ACSL3O95573 720 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CCNE2O96020 404 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 RARAP10276 462 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CHN1P15882 459 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 PTGIRP43119 386 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 GPC5P78333 572 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 MTMR1Q13613 665 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 LRIG3Q6UXM1 1119 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 PSMD1Q99460 953 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 HEMGNQ9BXL5 484 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 TRAPPC3O43617 180 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 NF2P35240 595 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 FNTAP49354 379 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 MNAT1P51948 309 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 PPP2R5AQ15172 486 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.42■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CFHP08603 1231 aa24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 FMO1Q01740 532 aa24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 PASD1Q8IV76 773 aa24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CD248Q9HCU0 757 aa24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 PEX10O60683 326 aa24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 SPOPLQ6IQ16 392 aa24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SAMD4B-208ENST00000598913 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms