RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 PPM1AP35813 382 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 RAD54LQ92698 747 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 MYO7AQ13402 2215 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC169A6NNP5 214 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 K7ERI5 159 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 N4BP3O15049 544 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 DDHD2O94830 711 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 F13A1P00488 732 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 GALTP07902 379 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 PLS3P13797 630 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 ERVFC1P60507 584 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 HYAL1Q12794 435 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 MCM6Q14566 821 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 URGCPQ8TCY9 931 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 GAD1Q99259 594 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 ARL5CA6NH57 179 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 FSCN2O14926 492 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 LIG1P18858 919 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 DDIT3P35638 169 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 GPBP1Q86WP2 473 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 ZFP42Q96MM3 310 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 TLR9Q9NR96 1032 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 MIOSQ9NXC5 875 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 SLC16A4O15374 487 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.168e-7■■■□□ 16.9
UBXN6-206ENST00000590466 CSPG5O95196 566 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 POMCP01189 267 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 AKAP5P24588 427 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 MLH1P40692 756 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 REEP2Q9BRK0 252 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 APOL6Q9BWW8 343 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-206ENST00000590466 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 CARNS1A5YM72 827 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 SPTLC2O15270 562 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 PPP6R2O75170 966 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 YEATS4O95619 227 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 BMP1P13497 986 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 SLC11A1P49279 550 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF131P52739 623 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 KRT17Q04695 432 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 DSC1Q08554 894 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 GIT2Q14161 759 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 STK38Q15208 465 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 AAK1Q2M2I8 961 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 HACE1Q8IYU2 909 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 KCNN1Q92952 543 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 STK17AQ9UEE5 414 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-206ENST00000590466 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms