RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557403.5

RBM23-229, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-229	ENST00000557403	BACH2	Q9BYV9	841 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	RAB34	Q9BZG1	259 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	GBP3	Q9H0R5	595 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	TLR9	Q9NR96	1032 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NCOR1	O75376	2440 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	LAD1	O00515	517 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	B4GALT5	O43286	388 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NCK2	O43639	380 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ZNF623	O75123	536 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	TBX10	O75333	385 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	IL9	P15248	144 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	MUT	P22033	750 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PPM1A	P35813	382 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NDUFV1	P49821	464 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	BCAR1	P56945	870 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ERVFC1	P60507	584 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PLCB3	Q01970	1234 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	COL19A1	Q14993	1142 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NOTUM	Q6P988	496 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PADI6	Q6TGC4	694 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	URGCP	Q8TCY9	931 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	RSAD1	Q9HA92	442 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	SPG21	Q9NZD8	308 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PER2	O15055	1255 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	OFD1	O75665	1012 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ITGA4	P13612	1032 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	LIG1	P18858	919 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CYP11B2	P19099	503 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CDC25A	P30304	524 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	AXL	P30530	894 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CA8	P35219	290 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	LTBR	P36941	435 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PRPH	P41219	470 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	KRT17	Q04695	432 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PDIA5	Q14554	519 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	IL17A	Q16552	155 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	AMHR2	Q16671	573 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	KRT79	Q5XKE5	535 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	BSND	Q8WZ55	320 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CCDC51	Q96ER9	411 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	TCF25	Q9BQ70	676 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	APOL6	Q9BWW8	343 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CSRNP2	Q9H175	543 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	TLE6	Q9H808	572 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	POLD4	Q9HCU8	107 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	LZTS1	Q9Y250	596 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	HES2	Q9Y543	173 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	IPP	Q9Y573	584 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	C5orf42	Q9H799	3197 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403		E9PMD0	336 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	FSCN2	O14926	492 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	B4GALT3	O60512	393 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NPTXR	O95502	500 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	GLP2R	O95838	553 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	POMC	P01189	267 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	MLH1	P40692	756 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-229	ENST00000557403	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79

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