RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555616.5

ACTN1-215, Transcript of actinin alpha 1, human

TSL 3

Gene ACTN1, Length 919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTN1-215	ENST00000555616	NCK2	O43639	380 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	NR1I2	O75469	434 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF202	O95125	648 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CYP11B2	P19099	503 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	KCNA5	P22460	613 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CDC25A	P30304	524 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	AXL	P30530	894 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	IRS1	P35568	1242 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	STAT6	P42226	847 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PLCB3	Q01970	1234 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	HYAL1	Q12794	435 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	KANK3	Q6NY19	840 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	USP49	Q70CQ1	688 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PDILT	Q8N807	584 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	LPP	Q93052	612 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PGBD4	Q96DM1	585 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	TIGD1	Q96MW7	591 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF558	Q96NG5	402 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CUEDC2	Q9H467	287 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	LZTS1	Q9Y250	596 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CARNS1	A5YM72	827 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	FSCN2	O14926	492 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	INPPL1	O15357	1258 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PLCG1	P19174	1290 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	NAMPT	P43490	491 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	HYI	Q5T013	277 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	NOTUM	Q6P988	496 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	BSND	Q8WZ55	320 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	DHX58	Q96C10	678 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PANK2	Q9BZ23	570 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	TLR9	Q9NR96	1032 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	TNFRSF10A	O00220	468 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	B4GALT5	O43286	388 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	OFD1	O75665	1012 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CSPG5	O95196	566 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	EYA4	O95677	639 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	SLFN14	P0C7P3	912 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	LTBR	P36941	435 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PBX3	P40426	434 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	FAM187B	Q17R55	369 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	EFHB	Q8N7U6	833 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	KIFAP3	Q92845	792 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	FZD8	Q9H461	694 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	RSAD1	Q9HA92	442 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	SPG21	Q9NZD8	308 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	IPP	Q9Y573	584 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	NCOR1	O75376	2440 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616		A0A087X0B3	334 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616		A0A1B0GUA9	196 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ACTN1-215	ENST00000555616	FSD2	A1L4K1	749 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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