RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 UBE4BO95155 1302 aa19.97■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 CTNNA2P26232 953 aa19.97■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 LRRC34Q8IZ02 419 aa19.97■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 LMO3Q8TAP4 145 aa19.97■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAGEC3Q8TD91 643 aa19.97■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZSWIM1Q9BR11 485 aa19.97■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 SEL1LQ9UBV2 794 aa19.97■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 ATRNL1Q5VV63 1379 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 RAD17O75943 681 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 GBP1P32455 592 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF131P52739 623 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 BFSP1Q12934 665 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 RDH13Q8NBN7 331 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 HOOK2Q96ED9 719 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 CAMKK2Q96RR4 588 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 PARP2Q9UGN5 583 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 MGRN1O60291 552 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 EXOC3O60645 756 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 BCRP11274 1271 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 ITIH4Q14624 930 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 ODR4Q5SWX8 454 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 LRCH2Q5VUJ6 765 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 CROCCP2Q86T23 111 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 CDAN1Q8IWY9 1227 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 WDR18Q9BV38 432 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
RPS6KL1-209ENST00000555009 PFASO15067 1338 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 FGFR4P22455 802 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 RFX1P22670 979 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 ECE1P42892 770 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 SLCO1A2P46721 670 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 GIMAP7Q8NHV1 300 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMEM109Q9BVC6 243 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 MTFR1LQ9H019 292 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 PSMD10O75832 226 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 GMCL1Q96IK5 515 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC134Q9H6E4 229 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 SAMD15Q9P1V8 674 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 RIPK2O43353 540 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 COMTP21964 271 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 PEX5P50542 639 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 GPC5P78333 572 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 TCEAL1Q15170 157 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 RPS6KC1Q96S38 1066 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 SLC12A4Q9UP95 1085 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 BCS1LQ9Y276 419 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 PSME4Q14997 1843 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 VIMP08670 466 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 PPP2R5CQ13362 524 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 MESDQ14696 234 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 PPP1R7Q15435 360 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 SEL1L2Q5TEA6 688 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 BTNL9Q6UXG8 535 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 SYCP3Q8IZU3 236 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 STK32BQ9NY57 414 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 ODF2LQ9ULJ1 636 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 PIK3CDO00329 1044 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 RASGRF2O14827 1237 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 ENTPD3O75355 529 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 GGPS1O95749 300 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 GSTA1P08263 222 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 ALAS1P13196 640 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 RARGP13631 454 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 SLMAPQ14BN4 828 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 NBPF9Q3BBW0 867 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 SLC9A9Q8IVB4 645 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 BANK1Q8NDB2 785 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 PYGMP11217 842 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 NF2P35240 595 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 IFNAR2P48551 515 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 DLG4P78352 724 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARHGEF19Q8IW93 802 aa19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms