RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 NOTCH4Q99466 2003 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF862O60290 1169 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 GNAQP50148 359 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 ADCY1Q08828 1119 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 FAM167AQ96KS9 214 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM4-202ENST00000547188 E7EWF7 191 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 EFEMP2O95967 443 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 OATP04181 439 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 NIPA1Q7RTP0 329 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 ITFG1Q8TB96 612 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF577Q9BSK1 485 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 SAMM50Q9Y512 469 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 HIP1O00291 1037 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 HRO43593 1189 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 FOSP01100 380 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 SREBF1P36956 1147 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 NRBP2Q9NSY0 501 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 SOBPA7XYQ1 873 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 TM4SF5O14894 197 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 COLGALT2Q8IYK4 626 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 MAP4K1Q92918 833 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 CHRDQ9H2X0 955 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 NAPAP54920 295 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 PRKCEQ02156 737 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 CHST7Q9NS84 486 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 RXFP3Q9NSD7 469 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 POLIQ9UNA4 740 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 UGCGQ16739 394 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 NFXL1Q6ZNB6 911 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 TBC1D22BQ9NU19 505 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 CCL16O15467 120 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 FNTBP49356 437 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 ADCY7P51828 1080 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 PPP2R5DQ14738 602 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC6Q16204 474 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 KSR1Q8IVT5 923 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF687Q8N1G0 1237 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 ING5Q8WYH8 240 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 GPR62Q9BZJ7 368 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM4-202ENST00000547188 C1RP00736 705 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 SATB1Q01826 763 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 PTH1RQ03431 593 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 RHPN2Q8IUC4 686 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 MBOAT7Q96N66 472 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 FNIP2Q9P278 1114 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM150BA6NC51 233 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 KCNK5O95279 499 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 CCR3P51677 355 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 LIMK1P53667 647 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 NPAS3Q8IXF0 933 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 NLRP4Q96MN2 994 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 SPAG17Q6Q759 2223 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 MTERF2Q49AM1 385 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 PPM1LQ5SGD2 360 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 UBXN11Q5T124 520 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 LMAN1LQ9HAT1 526 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 FBXW11Q9UKB1 542 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 SMCO2A6NFE2 343 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC69A6NI79 296 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
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