RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 GPS1Q13098 491 aa20.63■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.63■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TMEM120BA0PK00 339 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 MYMKA6NI61 221 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TTC36A6NLP5 189 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 MAP2K7O14733 419 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 KITP10721 976 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 CEP95Q96GE4 821 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 UTYO14607 1347 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 RAPGEF5Q92565 580 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TRABDQ9H4I3 376 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ZWILCHQ9H900 591 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 MEGF6O75095 1541 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 CAPN9O14815 690 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ZBED1O96006 694 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SCTRP47872 440 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 STAT2P52630 851 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 STX1BP61266 288 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 FAM20AQ96MK3 541 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TLK1Q9UKI8 766 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 NTSR2O95665 410 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 APOEP02649 317 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 HERVK_113P62684 666 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SLC29A2Q14542 456 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 METTL13Q8N6R0 699 aa20.62■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF233A6NK53 670 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 FAM196BA6NMK8 535 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 PDXKO00764 312 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 GH2P01242 217 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 PGM1P36871 562 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 KRT3P12035 628 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SP8Q8IXZ3 490 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TEX9Q8N6V9 391 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 FAF2Q96CS3 445 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 AGPAT1Q99943 283 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 RFX1P22670 979 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 DNAJC9Q8WXX5 260 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 WDR64B1ANS9 1081 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 LPXNO60711 386 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 STAT3P40763 770 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 VAMP7P51809 220 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ERICH1Q86X53 443 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 HDAC11Q96DB2 347 aa20.61■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 DCLK2Q8N568 766 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TTC13Q8NBP0 860 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 CCNYQ8ND76 341 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ATL2Q8NHH9 583 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 NOD1Q9Y239 953 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 PRPSAP2O60256 369 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 PSMA2P25787 234 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ERFP50548 548 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SNAP25P60880 206 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ANO5Q75V66 913 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 C9orf72Q96LT7 481 aa20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SH3BP5O60239 455 aa20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SLC9A1P19634 815 aa20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 PASD1Q8IV76 773 aa20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 PPM1NQ8N819 430 aa20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 TMBIM4Q9HC24 238 aa20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 COX16Q9P0S2 106 aa20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 HSPA4LO95757 839 aa20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 ITIH2P19823 946 aa20.59■□□□□ 0.89
SUDS3-204ENST00000543473 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms